Protein–RNA interactions for Protein: Q03167

TGFBR3, Transforming growth factor beta receptor type 3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR3Q03167 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TGFBR3Q03167 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TGFBR3Q03167 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TGFBR3Q03167 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TGFBR3Q03167 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TGFBR3Q03167 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
TGFBR3Q03167 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TGFBR3Q03167 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
TGFBR3Q03167 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TGFBR3Q03167 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TGFBR3Q03167 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TGFBR3Q03167 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TGFBR3Q03167 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
TGFBR3Q03167 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TGFBR3Q03167 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TGFBR3Q03167 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TGFBR3Q03167 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TGFBR3Q03167 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
TGFBR3Q03167 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TGFBR3Q03167 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TGFBR3Q03167 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TGFBR3Q03167 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TGFBR3Q03167 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TGFBR3Q03167 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TGFBR3Q03167 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TGFBR3Q03167 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TGFBR3Q03167 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TGFBR3Q03167 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TGFBR3Q03167 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TGFBR3Q03167 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TGFBR3Q03167 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TGFBR3Q03167 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TGFBR3Q03167 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TGFBR3Q03167 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TGFBR3Q03167 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TGFBR3Q03167 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
TGFBR3Q03167 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TGFBR3Q03167 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TGFBR3Q03167 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TGFBR3Q03167 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TGFBR3Q03167 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TGFBR3Q03167 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TGFBR3Q03167 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TGFBR3Q03167 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TGFBR3Q03167 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TGFBR3Q03167 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TGFBR3Q03167 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TGFBR3Q03167 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TGFBR3Q03167 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TGFBR3Q03167 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TGFBR3Q03167 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TGFBR3Q03167 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TGFBR3Q03167 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
TGFBR3Q03167 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TGFBR3Q03167 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
TGFBR3Q03167 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TGFBR3Q03167 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TGFBR3Q03167 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
TGFBR3Q03167 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TGFBR3Q03167 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TGFBR3Q03167 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TGFBR3Q03167 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TGFBR3Q03167 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TGFBR3Q03167 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TGFBR3Q03167 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
TGFBR3Q03167 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TGFBR3Q03167 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TGFBR3Q03167 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TGFBR3Q03167 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TGFBR3Q03167 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TGFBR3Q03167 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TGFBR3Q03167 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TGFBR3Q03167 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TGFBR3Q03167 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TGFBR3Q03167 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TGFBR3Q03167 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TGFBR3Q03167 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TGFBR3Q03167 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TGFBR3Q03167 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TGFBR3Q03167 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TGFBR3Q03167 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TGFBR3Q03167 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TGFBR3Q03167 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
TGFBR3Q03167 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TGFBR3Q03167 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TGFBR3Q03167 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TGFBR3Q03167 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TGFBR3Q03167 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TGFBR3Q03167 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TGFBR3Q03167 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TGFBR3Q03167 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TGFBR3Q03167 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TGFBR3Q03167 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TGFBR3Q03167 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TGFBR3Q03167 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TGFBR3Q03167 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TGFBR3Q03167 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TGFBR3Q03167 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TGFBR3Q03167 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TGFBR3Q03167 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms