Protein–RNA interactions for Protein: Q02509

OC90, Otoconin-90, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OC90Q02509 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
OC90Q02509 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
OC90Q02509 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
OC90Q02509 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
OC90Q02509 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
OC90Q02509 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
OC90Q02509 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
OC90Q02509 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
OC90Q02509 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
OC90Q02509 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
OC90Q02509 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
OC90Q02509 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
OC90Q02509 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
OC90Q02509 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
OC90Q02509 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
OC90Q02509 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
OC90Q02509 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
OC90Q02509 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
OC90Q02509 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
OC90Q02509 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
OC90Q02509 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
OC90Q02509 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
OC90Q02509 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
OC90Q02509 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
OC90Q02509 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
OC90Q02509 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
OC90Q02509 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
OC90Q02509 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
OC90Q02509 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
OC90Q02509 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
OC90Q02509 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
OC90Q02509 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
OC90Q02509 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
OC90Q02509 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
OC90Q02509 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
OC90Q02509 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
OC90Q02509 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
OC90Q02509 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
OC90Q02509 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
OC90Q02509 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
OC90Q02509 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
OC90Q02509 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
OC90Q02509 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
OC90Q02509 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
OC90Q02509 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
OC90Q02509 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
OC90Q02509 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
OC90Q02509 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
OC90Q02509 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
OC90Q02509 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
OC90Q02509 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
OC90Q02509 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
OC90Q02509 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
OC90Q02509 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
OC90Q02509 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
OC90Q02509 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
OC90Q02509 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
OC90Q02509 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
OC90Q02509 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
OC90Q02509 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
OC90Q02509 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
OC90Q02509 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
OC90Q02509 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
OC90Q02509 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
OC90Q02509 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
OC90Q02509 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
OC90Q02509 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
OC90Q02509 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
OC90Q02509 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
OC90Q02509 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
OC90Q02509 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
OC90Q02509 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
OC90Q02509 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
OC90Q02509 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
OC90Q02509 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
OC90Q02509 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
OC90Q02509 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
OC90Q02509 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
OC90Q02509 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
OC90Q02509 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
OC90Q02509 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
OC90Q02509 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
OC90Q02509 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
OC90Q02509 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
OC90Q02509 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
OC90Q02509 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
OC90Q02509 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
OC90Q02509 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
OC90Q02509 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
OC90Q02509 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
OC90Q02509 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
OC90Q02509 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
OC90Q02509 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
OC90Q02509 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
OC90Q02509 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
OC90Q02509 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
OC90Q02509 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
OC90Q02509 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
OC90Q02509 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
OC90Q02509 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms