Protein–RNA interactions for Protein: Q01826

SATB1, DNA-binding protein SATB1, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SATB1Q01826 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SATB1Q01826 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SATB1Q01826 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SATB1Q01826 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SATB1Q01826 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SATB1Q01826 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SATB1Q01826 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SATB1Q01826 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SATB1Q01826 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SATB1Q01826 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SATB1Q01826 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SATB1Q01826 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SATB1Q01826 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SATB1Q01826 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SATB1Q01826 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SATB1Q01826 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SATB1Q01826 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SATB1Q01826 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SATB1Q01826 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SATB1Q01826 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SATB1Q01826 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SATB1Q01826 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SATB1Q01826 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SATB1Q01826 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SATB1Q01826 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SATB1Q01826 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SATB1Q01826 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SATB1Q01826 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SATB1Q01826 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SATB1Q01826 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SATB1Q01826 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SATB1Q01826 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SATB1Q01826 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SATB1Q01826 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SATB1Q01826 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SATB1Q01826 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SATB1Q01826 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SATB1Q01826 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SATB1Q01826 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SATB1Q01826 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SATB1Q01826 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SATB1Q01826 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SATB1Q01826 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SATB1Q01826 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SATB1Q01826 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SATB1Q01826 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SATB1Q01826 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SATB1Q01826 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SATB1Q01826 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23■■□□□ 1.27
SATB1Q01826 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SATB1Q01826 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SATB1Q01826 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SATB1Q01826 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SATB1Q01826 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SATB1Q01826 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SATB1Q01826 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SATB1Q01826 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SATB1Q01826 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SATB1Q01826 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
SATB1Q01826 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SATB1Q01826 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SATB1Q01826 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SATB1Q01826 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SATB1Q01826 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SATB1Q01826 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SATB1Q01826 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SATB1Q01826 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SATB1Q01826 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SATB1Q01826 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SATB1Q01826 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SATB1Q01826 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SATB1Q01826 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SATB1Q01826 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SATB1Q01826 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SATB1Q01826 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SATB1Q01826 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SATB1Q01826 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SATB1Q01826 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SATB1Q01826 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SATB1Q01826 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SATB1Q01826 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SATB1Q01826 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SATB1Q01826 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SATB1Q01826 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SATB1Q01826 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SATB1Q01826 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SATB1Q01826 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SATB1Q01826 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SATB1Q01826 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SATB1Q01826 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SATB1Q01826 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SATB1Q01826 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SATB1Q01826 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SATB1Q01826 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SATB1Q01826 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SATB1Q01826 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SATB1Q01826 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SATB1Q01826 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SATB1Q01826 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SATB1Q01826 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms