Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
SCN7AQ01118 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
SCN7AQ01118 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SCN7AQ01118 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SCN7AQ01118 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SCN7AQ01118 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SCN7AQ01118 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SCN7AQ01118 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SCN7AQ01118 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SCN7AQ01118 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
SCN7AQ01118 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
SCN7AQ01118 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SCN7AQ01118 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SCN7AQ01118 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SCN7AQ01118 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SCN7AQ01118 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SCN7AQ01118 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SCN7AQ01118 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SCN7AQ01118 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SCN7AQ01118 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SCN7AQ01118 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SCN7AQ01118 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SCN7AQ01118 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SCN7AQ01118 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SCN7AQ01118 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
SCN7AQ01118 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SCN7AQ01118 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SCN7AQ01118 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SCN7AQ01118 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SCN7AQ01118 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SCN7AQ01118 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SCN7AQ01118 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SCN7AQ01118 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SCN7AQ01118 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SCN7AQ01118 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SCN7AQ01118 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SCN7AQ01118 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SCN7AQ01118 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SCN7AQ01118 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SCN7AQ01118 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SCN7AQ01118 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SCN7AQ01118 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SCN7AQ01118 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SCN7AQ01118 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SCN7AQ01118 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SCN7AQ01118 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SCN7AQ01118 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SCN7AQ01118 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SCN7AQ01118 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SCN7AQ01118 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SCN7AQ01118 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SCN7AQ01118 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SCN7AQ01118 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SCN7AQ01118 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SCN7AQ01118 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SCN7AQ01118 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SCN7AQ01118 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SCN7AQ01118 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SCN7AQ01118 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SCN7AQ01118 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SCN7AQ01118 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SCN7AQ01118 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SCN7AQ01118 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SCN7AQ01118 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SCN7AQ01118 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SCN7AQ01118 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SCN7AQ01118 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SCN7AQ01118 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SCN7AQ01118 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SCN7AQ01118 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SCN7AQ01118 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SCN7AQ01118 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SCN7AQ01118 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
SCN7AQ01118 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SCN7AQ01118 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SCN7AQ01118 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SCN7AQ01118 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
SCN7AQ01118 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SCN7AQ01118 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SCN7AQ01118 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SCN7AQ01118 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SCN7AQ01118 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SCN7AQ01118 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SCN7AQ01118 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SCN7AQ01118 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SCN7AQ01118 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SCN7AQ01118 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SCN7AQ01118 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SCN7AQ01118 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
SCN7AQ01118 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
SCN7AQ01118 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SCN7AQ01118 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SCN7AQ01118 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SCN7AQ01118 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SCN7AQ01118 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SCN7AQ01118 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SCN7AQ01118 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SCN7AQ01118 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SCN7AQ01118 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SCN7AQ01118 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms