Protein–RNA interactions for Protein: Q00888

PSG4, Pregnancy-specific beta-1-glycoprotein 4, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSG4Q00888 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSG4Q00888 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSG4Q00888 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSG4Q00888 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSG4Q00888 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSG4Q00888 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSG4Q00888 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSG4Q00888 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSG4Q00888 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSG4Q00888 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSG4Q00888 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSG4Q00888 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSG4Q00888 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSG4Q00888 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSG4Q00888 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSG4Q00888 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSG4Q00888 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSG4Q00888 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSG4Q00888 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSG4Q00888 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSG4Q00888 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSG4Q00888 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSG4Q00888 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSG4Q00888 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSG4Q00888 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSG4Q00888 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSG4Q00888 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PSG4Q00888 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PSG4Q00888 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSG4Q00888 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSG4Q00888 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSG4Q00888 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSG4Q00888 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSG4Q00888 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PSG4Q00888 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSG4Q00888 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSG4Q00888 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSG4Q00888 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSG4Q00888 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSG4Q00888 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSG4Q00888 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSG4Q00888 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSG4Q00888 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSG4Q00888 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PSG4Q00888 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PSG4Q00888 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PSG4Q00888 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PSG4Q00888 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PSG4Q00888 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PSG4Q00888 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PSG4Q00888 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PSG4Q00888 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PSG4Q00888 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PSG4Q00888 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PSG4Q00888 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PSG4Q00888 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PSG4Q00888 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PSG4Q00888 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PSG4Q00888 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PSG4Q00888 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PSG4Q00888 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PSG4Q00888 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PSG4Q00888 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PSG4Q00888 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PSG4Q00888 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PSG4Q00888 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PSG4Q00888 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PSG4Q00888 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PSG4Q00888 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PSG4Q00888 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PSG4Q00888 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PSG4Q00888 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PSG4Q00888 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PSG4Q00888 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PSG4Q00888 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PSG4Q00888 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PSG4Q00888 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PSG4Q00888 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PSG4Q00888 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PSG4Q00888 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PSG4Q00888 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PSG4Q00888 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PSG4Q00888 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PSG4Q00888 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PSG4Q00888 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PSG4Q00888 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PSG4Q00888 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PSG4Q00888 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PSG4Q00888 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PSG4Q00888 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PSG4Q00888 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PSG4Q00888 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PSG4Q00888 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PSG4Q00888 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PSG4Q00888 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PSG4Q00888 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PSG4Q00888 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PSG4Q00888 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PSG4Q00888 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PSG4Q00888 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms