Protein–RNA interactions for Protein: Q00604

NDP, Norrin, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDPQ00604 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NDPQ00604 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NDPQ00604 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NDPQ00604 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NDPQ00604 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NDPQ00604 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NDPQ00604 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NDPQ00604 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NDPQ00604 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NDPQ00604 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NDPQ00604 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NDPQ00604 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NDPQ00604 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NDPQ00604 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NDPQ00604 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NDPQ00604 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NDPQ00604 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NDPQ00604 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NDPQ00604 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NDPQ00604 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NDPQ00604 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NDPQ00604 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NDPQ00604 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NDPQ00604 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NDPQ00604 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NDPQ00604 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NDPQ00604 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NDPQ00604 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NDPQ00604 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NDPQ00604 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NDPQ00604 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NDPQ00604 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NDPQ00604 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NDPQ00604 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NDPQ00604 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NDPQ00604 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NDPQ00604 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NDPQ00604 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NDPQ00604 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NDPQ00604 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NDPQ00604 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NDPQ00604 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NDPQ00604 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NDPQ00604 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NDPQ00604 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NDPQ00604 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NDPQ00604 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NDPQ00604 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NDPQ00604 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NDPQ00604 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NDPQ00604 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
NDPQ00604 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NDPQ00604 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NDPQ00604 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NDPQ00604 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NDPQ00604 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NDPQ00604 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NDPQ00604 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NDPQ00604 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NDPQ00604 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NDPQ00604 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NDPQ00604 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NDPQ00604 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
NDPQ00604 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NDPQ00604 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NDPQ00604 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NDPQ00604 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NDPQ00604 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NDPQ00604 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NDPQ00604 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NDPQ00604 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NDPQ00604 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NDPQ00604 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NDPQ00604 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NDPQ00604 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NDPQ00604 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NDPQ00604 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NDPQ00604 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NDPQ00604 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NDPQ00604 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NDPQ00604 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NDPQ00604 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NDPQ00604 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
NDPQ00604 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NDPQ00604 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NDPQ00604 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
NDPQ00604 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NDPQ00604 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NDPQ00604 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NDPQ00604 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NDPQ00604 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NDPQ00604 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NDPQ00604 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NDPQ00604 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NDPQ00604 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NDPQ00604 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NDPQ00604 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NDPQ00604 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NDPQ00604 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NDPQ00604 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms