Protein–RNA interactions for Protein: P82933

MRPS9, 28S ribosomal protein S9, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPS9P82933 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MRPS9P82933 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MRPS9P82933 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MRPS9P82933 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MRPS9P82933 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MRPS9P82933 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MRPS9P82933 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MRPS9P82933 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MRPS9P82933 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MRPS9P82933 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MRPS9P82933 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MRPS9P82933 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MRPS9P82933 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MRPS9P82933 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MRPS9P82933 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MRPS9P82933 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MRPS9P82933 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MRPS9P82933 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MRPS9P82933 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MRPS9P82933 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MRPS9P82933 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MRPS9P82933 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MRPS9P82933 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MRPS9P82933 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MRPS9P82933 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MRPS9P82933 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MRPS9P82933 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MRPS9P82933 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MRPS9P82933 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MRPS9P82933 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MRPS9P82933 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MRPS9P82933 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MRPS9P82933 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MRPS9P82933 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
MRPS9P82933 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MRPS9P82933 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MRPS9P82933 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MRPS9P82933 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MRPS9P82933 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MRPS9P82933 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MRPS9P82933 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MRPS9P82933 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MRPS9P82933 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MRPS9P82933 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MRPS9P82933 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MRPS9P82933 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MRPS9P82933 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MRPS9P82933 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MRPS9P82933 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MRPS9P82933 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MRPS9P82933 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MRPS9P82933 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MRPS9P82933 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MRPS9P82933 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MRPS9P82933 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MRPS9P82933 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MRPS9P82933 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
MRPS9P82933 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
MRPS9P82933 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
MRPS9P82933 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
MRPS9P82933 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MRPS9P82933 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MRPS9P82933 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MRPS9P82933 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MRPS9P82933 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MRPS9P82933 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MRPS9P82933 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MRPS9P82933 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MRPS9P82933 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MRPS9P82933 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MRPS9P82933 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MRPS9P82933 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MRPS9P82933 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MRPS9P82933 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MRPS9P82933 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MRPS9P82933 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
MRPS9P82933 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MRPS9P82933 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MRPS9P82933 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MRPS9P82933 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MRPS9P82933 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MRPS9P82933 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MRPS9P82933 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MRPS9P82933 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MRPS9P82933 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MRPS9P82933 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MRPS9P82933 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MRPS9P82933 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MRPS9P82933 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MRPS9P82933 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MRPS9P82933 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MRPS9P82933 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MRPS9P82933 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MRPS9P82933 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MRPS9P82933 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MRPS9P82933 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MRPS9P82933 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
MRPS9P82933 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
MRPS9P82933 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
MRPS9P82933 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms