Protein–RNA interactions for Protein: P63261

ACTG1, Actin, cytoplasmic 2, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTG1P63261 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACTG1P63261 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACTG1P63261 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACTG1P63261 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACTG1P63261 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACTG1P63261 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACTG1P63261 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACTG1P63261 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACTG1P63261 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACTG1P63261 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACTG1P63261 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACTG1P63261 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACTG1P63261 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACTG1P63261 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACTG1P63261 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACTG1P63261 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACTG1P63261 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACTG1P63261 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACTG1P63261 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACTG1P63261 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACTG1P63261 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACTG1P63261 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACTG1P63261 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACTG1P63261 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACTG1P63261 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACTG1P63261 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACTG1P63261 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACTG1P63261 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACTG1P63261 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ACTG1P63261 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACTG1P63261 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACTG1P63261 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACTG1P63261 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACTG1P63261 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACTG1P63261 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACTG1P63261 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACTG1P63261 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACTG1P63261 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACTG1P63261 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACTG1P63261 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACTG1P63261 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACTG1P63261 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ACTG1P63261 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACTG1P63261 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACTG1P63261 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACTG1P63261 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACTG1P63261 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACTG1P63261 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACTG1P63261 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ACTG1P63261 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACTG1P63261 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACTG1P63261 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACTG1P63261 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACTG1P63261 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACTG1P63261 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACTG1P63261 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACTG1P63261 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ACTG1P63261 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACTG1P63261 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACTG1P63261 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACTG1P63261 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACTG1P63261 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACTG1P63261 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACTG1P63261 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACTG1P63261 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACTG1P63261 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACTG1P63261 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACTG1P63261 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTG1P63261 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTG1P63261 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTG1P63261 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTG1P63261 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTG1P63261 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTG1P63261 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTG1P63261 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTG1P63261 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTG1P63261 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTG1P63261 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTG1P63261 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTG1P63261 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTG1P63261 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTG1P63261 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTG1P63261 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTG1P63261 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTG1P63261 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTG1P63261 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTG1P63261 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTG1P63261 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTG1P63261 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTG1P63261 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTG1P63261 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTG1P63261 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTG1P63261 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTG1P63261 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTG1P63261 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTG1P63261 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTG1P63261 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTG1P63261 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTG1P63261 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTG1P63261 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms