Protein–RNA interactions for Protein: P62750

RPL23A, 60S ribosomal protein L23a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23AP62750 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPL23AP62750 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPL23AP62750 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPL23AP62750 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPL23AP62750 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPL23AP62750 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPL23AP62750 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPL23AP62750 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPL23AP62750 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPL23AP62750 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
RPL23AP62750 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RPL23AP62750 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RPL23AP62750 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RPL23AP62750 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL23AP62750 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL23AP62750 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL23AP62750 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL23AP62750 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL23AP62750 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL23AP62750 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL23AP62750 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL23AP62750 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL23AP62750 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL23AP62750 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL23AP62750 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL23AP62750 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL23AP62750 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL23AP62750 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL23AP62750 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL23AP62750 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL23AP62750 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL23AP62750 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPL23AP62750 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPL23AP62750 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPL23AP62750 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPL23AP62750 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPL23AP62750 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPL23AP62750 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPL23AP62750 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPL23AP62750 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPL23AP62750 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RPL23AP62750 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPL23AP62750 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPL23AP62750 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPL23AP62750 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPL23AP62750 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL23AP62750 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL23AP62750 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL23AP62750 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL23AP62750 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL23AP62750 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL23AP62750 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL23AP62750 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL23AP62750 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL23AP62750 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL23AP62750 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL23AP62750 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL23AP62750 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL23AP62750 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL23AP62750 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL23AP62750 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL23AP62750 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL23AP62750 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL23AP62750 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL23AP62750 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL23AP62750 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL23AP62750 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL23AP62750 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL23AP62750 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL23AP62750 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL23AP62750 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL23AP62750 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL23AP62750 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL23AP62750 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL23AP62750 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL23AP62750 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL23AP62750 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL23AP62750 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL23AP62750 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL23AP62750 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL23AP62750 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL23AP62750 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL23AP62750 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL23AP62750 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL23AP62750 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL23AP62750 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL23AP62750 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL23AP62750 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL23AP62750 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL23AP62750 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL23AP62750 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL23AP62750 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL23AP62750 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL23AP62750 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL23AP62750 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL23AP62750 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL23AP62750 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL23AP62750 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL23AP62750 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPL23AP62750 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms