Protein–RNA interactions for Protein: P62330

ARF6, ADP-ribosylation factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF6P62330 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARF6P62330 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARF6P62330 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARF6P62330 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARF6P62330 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARF6P62330 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARF6P62330 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARF6P62330 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARF6P62330 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARF6P62330 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARF6P62330 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ARF6P62330 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARF6P62330 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARF6P62330 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARF6P62330 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARF6P62330 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARF6P62330 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARF6P62330 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARF6P62330 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ARF6P62330 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARF6P62330 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARF6P62330 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARF6P62330 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARF6P62330 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARF6P62330 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARF6P62330 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ARF6P62330 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ARF6P62330 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARF6P62330 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARF6P62330 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARF6P62330 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARF6P62330 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARF6P62330 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARF6P62330 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARF6P62330 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ARF6P62330 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARF6P62330 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARF6P62330 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARF6P62330 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARF6P62330 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARF6P62330 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARF6P62330 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARF6P62330 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARF6P62330 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ARF6P62330 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARF6P62330 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARF6P62330 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARF6P62330 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARF6P62330 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARF6P62330 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARF6P62330 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARF6P62330 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARF6P62330 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARF6P62330 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARF6P62330 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARF6P62330 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ARF6P62330 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARF6P62330 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARF6P62330 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARF6P62330 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARF6P62330 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARF6P62330 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARF6P62330 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARF6P62330 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARF6P62330 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARF6P62330 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARF6P62330 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARF6P62330 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARF6P62330 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARF6P62330 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARF6P62330 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARF6P62330 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARF6P62330 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARF6P62330 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARF6P62330 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARF6P62330 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARF6P62330 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARF6P62330 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARF6P62330 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARF6P62330 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARF6P62330 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARF6P62330 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ARF6P62330 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARF6P62330 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARF6P62330 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ARF6P62330 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ARF6P62330 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ARF6P62330 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARF6P62330 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARF6P62330 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARF6P62330 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARF6P62330 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARF6P62330 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARF6P62330 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARF6P62330 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARF6P62330 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARF6P62330 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARF6P62330 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARF6P62330 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARF6P62330 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms