Protein–RNA interactions for Protein: P62068

USP46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46P62068 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP46P62068 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP46P62068 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP46P62068 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
USP46P62068 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP46P62068 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP46P62068 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP46P62068 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP46P62068 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP46P62068 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP46P62068 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP46P62068 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP46P62068 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP46P62068 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP46P62068 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP46P62068 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP46P62068 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP46P62068 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP46P62068 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP46P62068 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP46P62068 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP46P62068 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP46P62068 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP46P62068 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP46P62068 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP46P62068 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP46P62068 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP46P62068 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP46P62068 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP46P62068 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
USP46P62068 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP46P62068 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP46P62068 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP46P62068 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP46P62068 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP46P62068 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP46P62068 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP46P62068 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP46P62068 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP46P62068 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP46P62068 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP46P62068 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP46P62068 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP46P62068 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP46P62068 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP46P62068 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP46P62068 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP46P62068 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP46P62068 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP46P62068 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP46P62068 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP46P62068 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP46P62068 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP46P62068 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP46P62068 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP46P62068 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP46P62068 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP46P62068 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP46P62068 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP46P62068 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP46P62068 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
USP46P62068 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP46P62068 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP46P62068 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP46P62068 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP46P62068 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP46P62068 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP46P62068 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
USP46P62068 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP46P62068 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP46P62068 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP46P62068 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP46P62068 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP46P62068 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP46P62068 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP46P62068 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP46P62068 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP46P62068 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP46P62068 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP46P62068 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP46P62068 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
USP46P62068 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP46P62068 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP46P62068 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
USP46P62068 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP46P62068 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP46P62068 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP46P62068 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP46P62068 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP46P62068 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP46P62068 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP46P62068 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP46P62068 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP46P62068 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP46P62068 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP46P62068 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP46P62068 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP46P62068 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP46P62068 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP46P62068 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms