Protein–RNA interactions for Protein: P57768

SNX16, Sorting nexin-16, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX16P57768 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX16P57768 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX16P57768 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX16P57768 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX16P57768 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX16P57768 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX16P57768 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX16P57768 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX16P57768 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX16P57768 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX16P57768 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX16P57768 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX16P57768 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX16P57768 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX16P57768 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX16P57768 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX16P57768 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX16P57768 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX16P57768 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX16P57768 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX16P57768 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX16P57768 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX16P57768 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX16P57768 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX16P57768 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX16P57768 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX16P57768 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX16P57768 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX16P57768 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX16P57768 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX16P57768 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX16P57768 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX16P57768 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX16P57768 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX16P57768 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX16P57768 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX16P57768 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX16P57768 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX16P57768 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX16P57768 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX16P57768 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX16P57768 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX16P57768 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX16P57768 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX16P57768 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX16P57768 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX16P57768 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX16P57768 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX16P57768 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX16P57768 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX16P57768 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX16P57768 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX16P57768 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX16P57768 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX16P57768 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX16P57768 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX16P57768 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX16P57768 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX16P57768 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX16P57768 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX16P57768 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX16P57768 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX16P57768 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX16P57768 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX16P57768 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX16P57768 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX16P57768 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX16P57768 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX16P57768 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX16P57768 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX16P57768 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX16P57768 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
SNX16P57768 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX16P57768 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX16P57768 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX16P57768 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX16P57768 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX16P57768 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX16P57768 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX16P57768 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX16P57768 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX16P57768 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX16P57768 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX16P57768 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX16P57768 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX16P57768 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX16P57768 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX16P57768 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX16P57768 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX16P57768 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX16P57768 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX16P57768 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX16P57768 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX16P57768 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX16P57768 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX16P57768 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX16P57768 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX16P57768 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX16P57768 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX16P57768 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms