Protein–RNA interactions for Protein: P55056

APOC4, Apolipoprotein C-IV, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4P55056 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOC4P55056 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOC4P55056 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOC4P55056 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOC4P55056 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOC4P55056 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOC4P55056 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOC4P55056 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOC4P55056 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOC4P55056 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOC4P55056 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOC4P55056 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOC4P55056 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOC4P55056 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOC4P55056 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOC4P55056 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOC4P55056 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOC4P55056 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
APOC4P55056 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOC4P55056 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOC4P55056 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
APOC4P55056 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOC4P55056 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOC4P55056 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
APOC4P55056 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOC4P55056 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOC4P55056 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOC4P55056 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOC4P55056 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOC4P55056 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOC4P55056 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOC4P55056 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOC4P55056 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOC4P55056 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOC4P55056 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOC4P55056 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOC4P55056 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOC4P55056 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOC4P55056 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOC4P55056 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOC4P55056 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOC4P55056 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOC4P55056 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOC4P55056 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOC4P55056 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOC4P55056 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOC4P55056 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOC4P55056 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOC4P55056 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOC4P55056 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOC4P55056 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
APOC4P55056 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOC4P55056 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOC4P55056 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOC4P55056 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOC4P55056 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
APOC4P55056 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOC4P55056 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOC4P55056 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOC4P55056 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOC4P55056 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
APOC4P55056 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOC4P55056 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOC4P55056 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOC4P55056 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOC4P55056 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOC4P55056 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOC4P55056 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOC4P55056 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOC4P55056 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOC4P55056 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOC4P55056 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOC4P55056 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOC4P55056 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOC4P55056 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOC4P55056 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOC4P55056 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOC4P55056 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOC4P55056 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOC4P55056 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOC4P55056 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOC4P55056 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOC4P55056 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOC4P55056 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOC4P55056 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
APOC4P55056 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOC4P55056 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOC4P55056 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOC4P55056 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
APOC4P55056 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOC4P55056 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOC4P55056 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOC4P55056 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOC4P55056 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOC4P55056 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOC4P55056 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOC4P55056 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOC4P55056 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOC4P55056 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOC4P55056 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms