Protein–RNA interactions for Protein: P54845

NRL, Neural retina-specific leucine zipper protein, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRLP54845 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NRLP54845 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NRLP54845 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NRLP54845 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NRLP54845 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NRLP54845 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NRLP54845 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NRLP54845 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NRLP54845 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NRLP54845 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NRLP54845 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NRLP54845 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NRLP54845 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NRLP54845 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NRLP54845 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NRLP54845 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NRLP54845 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NRLP54845 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NRLP54845 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NRLP54845 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NRLP54845 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NRLP54845 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NRLP54845 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NRLP54845 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NRLP54845 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NRLP54845 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NRLP54845 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NRLP54845 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NRLP54845 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NRLP54845 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NRLP54845 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NRLP54845 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NRLP54845 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NRLP54845 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NRLP54845 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NRLP54845 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NRLP54845 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NRLP54845 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NRLP54845 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NRLP54845 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NRLP54845 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NRLP54845 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NRLP54845 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NRLP54845 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NRLP54845 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NRLP54845 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NRLP54845 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NRLP54845 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NRLP54845 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NRLP54845 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NRLP54845 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NRLP54845 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NRLP54845 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NRLP54845 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NRLP54845 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NRLP54845 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NRLP54845 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NRLP54845 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NRLP54845 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NRLP54845 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NRLP54845 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NRLP54845 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NRLP54845 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NRLP54845 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NRLP54845 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NRLP54845 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NRLP54845 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NRLP54845 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NRLP54845 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NRLP54845 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NRLP54845 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NRLP54845 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NRLP54845 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NRLP54845 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NRLP54845 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NRLP54845 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NRLP54845 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NRLP54845 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NRLP54845 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NRLP54845 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NRLP54845 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NRLP54845 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NRLP54845 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NRLP54845 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NRLP54845 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NRLP54845 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NRLP54845 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NRLP54845 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NRLP54845 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NRLP54845 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NRLP54845 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NRLP54845 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NRLP54845 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NRLP54845 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NRLP54845 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NRLP54845 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NRLP54845 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NRLP54845 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NRLP54845 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NRLP54845 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms