Protein–RNA interactions for Protein: P49914

MTHFS, 5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFSP49914 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
MTHFSP49914 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
MTHFSP49914 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
MTHFSP49914 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC29.71■■■□□ 2.35
MTHFSP49914 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.71■■■□□ 2.35
MTHFSP49914 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
MTHFSP49914 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
MTHFSP49914 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
MTHFSP49914 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
MTHFSP49914 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
MTHFSP49914 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.35
MTHFSP49914 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
MTHFSP49914 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
MTHFSP49914 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
MTHFSP49914 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
MTHFSP49914 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
MTHFSP49914 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
MTHFSP49914 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
MTHFSP49914 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
MTHFSP49914 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
MTHFSP49914 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
MTHFSP49914 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
MTHFSP49914 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
MTHFSP49914 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
MTHFSP49914 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
MTHFSP49914 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
MTHFSP49914 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
MTHFSP49914 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
MTHFSP49914 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
MTHFSP49914 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
MTHFSP49914 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
MTHFSP49914 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
MTHFSP49914 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
MTHFSP49914 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
MTHFSP49914 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC29.68■■■□□ 2.34
MTHFSP49914 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
MTHFSP49914 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
MTHFSP49914 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
MTHFSP49914 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
MTHFSP49914 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
MTHFSP49914 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
MTHFSP49914 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
MTHFSP49914 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
MTHFSP49914 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
MTHFSP49914 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
MTHFSP49914 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
MTHFSP49914 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
MTHFSP49914 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
MTHFSP49914 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
MTHFSP49914 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
MTHFSP49914 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
MTHFSP49914 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
MTHFSP49914 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
MTHFSP49914 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
MTHFSP49914 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
MTHFSP49914 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
MTHFSP49914 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
MTHFSP49914 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
MTHFSP49914 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
MTHFSP49914 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
MTHFSP49914 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
MTHFSP49914 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
MTHFSP49914 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
MTHFSP49914 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
MTHFSP49914 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
MTHFSP49914 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
MTHFSP49914 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
MTHFSP49914 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
MTHFSP49914 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
MTHFSP49914 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
MTHFSP49914 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
MTHFSP49914 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
MTHFSP49914 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
MTHFSP49914 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
MTHFSP49914 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
MTHFSP49914 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
MTHFSP49914 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
MTHFSP49914 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
MTHFSP49914 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
MTHFSP49914 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
MTHFSP49914 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
MTHFSP49914 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
MTHFSP49914 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
MTHFSP49914 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
MTHFSP49914 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
MTHFSP49914 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
MTHFSP49914 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
MTHFSP49914 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
MTHFSP49914 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
MTHFSP49914 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC29.61■■■□□ 2.33
MTHFSP49914 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
MTHFSP49914 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
MTHFSP49914 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
MTHFSP49914 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
MTHFSP49914 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
MTHFSP49914 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
MTHFSP49914 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
MTHFSP49914 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
MTHFSP49914 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
MTHFSP49914 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms