Protein–RNA interactions for Protein: P49815

TSC2, Tuberin, humanhuman

Predictions only

Length 1,807 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC2P49815 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TSC2P49815 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSC2P49815 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TSC2P49815 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSC2P49815 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSC2P49815 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSC2P49815 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSC2P49815 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSC2P49815 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSC2P49815 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSC2P49815 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSC2P49815 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSC2P49815 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSC2P49815 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSC2P49815 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSC2P49815 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSC2P49815 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSC2P49815 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSC2P49815 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSC2P49815 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSC2P49815 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSC2P49815 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSC2P49815 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSC2P49815 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSC2P49815 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSC2P49815 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSC2P49815 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSC2P49815 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSC2P49815 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSC2P49815 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSC2P49815 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSC2P49815 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSC2P49815 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSC2P49815 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSC2P49815 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSC2P49815 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSC2P49815 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TSC2P49815 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TSC2P49815 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TSC2P49815 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSC2P49815 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSC2P49815 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSC2P49815 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSC2P49815 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSC2P49815 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSC2P49815 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSC2P49815 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSC2P49815 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSC2P49815 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSC2P49815 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSC2P49815 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSC2P49815 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSC2P49815 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSC2P49815 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSC2P49815 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSC2P49815 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSC2P49815 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSC2P49815 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSC2P49815 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TSC2P49815 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TSC2P49815 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TSC2P49815 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSC2P49815 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSC2P49815 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSC2P49815 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSC2P49815 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSC2P49815 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSC2P49815 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSC2P49815 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSC2P49815 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSC2P49815 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSC2P49815 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSC2P49815 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSC2P49815 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSC2P49815 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSC2P49815 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSC2P49815 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSC2P49815 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSC2P49815 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSC2P49815 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TSC2P49815 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSC2P49815 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSC2P49815 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSC2P49815 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSC2P49815 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSC2P49815 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TSC2P49815 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TSC2P49815 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSC2P49815 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TSC2P49815 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TSC2P49815 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TSC2P49815 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TSC2P49815 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TSC2P49815 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TSC2P49815 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSC2P49815 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSC2P49815 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSC2P49815 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSC2P49815 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSC2P49815 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms