Protein–RNA interactions for Protein: P49588

AARS, Alanine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AARSP49588 TBC1D5-226ENST00000481396 609 ntTSL 414.39□□□□□ -0.116e-8■■■■■ 30.9
AARSP49588 TBC1D5-216ENST00000444471 680 ntTSL 314.39□□□□□ -0.116e-8■■■■■ 30.9
AARSP49588 DDX39A-218ENST00000592632 586 ntTSL 214.07□□□□□ -0.162e-6■■■■■ 30.9
AARSP49588 DDX39A-202ENST00000324340 1355 ntTSL 1 (best)13.58□□□□□ -0.232e-6■■■■■ 30.9
AARSP49588 TBC1D5-207ENST00000425944 591 ntTSL 413.54□□□□□ -0.246e-8■■■■■ 30.9
AARSP49588 PTTG1IP-207ENST00000494690 612 ntTSL 513.32□□□□□ -0.287e-7■■■■■ 30.9
AARSP49588 TBC1D5-218ENST00000445294 623 ntTSL 212.93□□□□□ -0.346e-8■■■■■ 30.9
AARSP49588 ARHGAP11B-209ENST00000602616 5637 ntTSL 312.89□□□□□ -0.356e-8■■■■■ 30.9
AARSP49588 ARHGAP11B-206ENST00000566548 484 ntTSL 312.51□□□□□ -0.416e-8■■■■■ 30.9
AARSP49588 TBC1D5-204ENST00000414349 687 ntTSL 312.42□□□□□ -0.426e-8■■■■■ 30.9
AARSP49588 DDX39A-210ENST00000589675 829 ntTSL 312.14□□□□□ -0.472e-6■■■■■ 30.9
AARSP49588 DDX39A-203ENST00000454233 922 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.562e-6■■■■■ 30.9
AARSP49588 CSNK1A1-201ENST00000261798 6067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.576e-8■■■■■ 30.9
AARSP49588 TBC1D5-202ENST00000412981 592 ntTSL 311.35□□□□□ -0.596e-8■■■■■ 30.9
AARSP49588 TBC1D5-215ENST00000443499 681 ntTSL 511.35□□□□□ -0.596e-8■■■■■ 30.9
AARSP49588 TBC1D5-208ENST00000428355 757 ntTSL 311.3□□□□□ -0.66e-8■■■■■ 30.9
AARSP49588 TBC1D5-229ENST00000497531 672 ntTSL 310.79□□□□□ -0.686e-8■■■■■ 30.9
AARSP49588 TBC1D5-211ENST00000430169 492 ntTSL 310.68□□□□□ -0.76e-8■■■■■ 30.9
AARSP49588 TBC1D5-205ENST00000415814 852 ntTSL 310.34□□□□□ -0.756e-8■■■■■ 30.9
AARSP49588 DDX39A-220ENST00000593008 538 ntTSL 310.33□□□□□ -0.762e-6■■■■■ 30.9
AARSP49588 TBC1D5-219ENST00000446818 3124 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.796e-8■■■■■ 30.9
AARSP49588 MBNL1-209ENST00000460591 898 ntTSL 39.77□□□□□ -0.856e-8■■■■■ 30.9
AARSP49588 SSBP4-208ENST00000600628 550 ntTSL 39.6□□□□□ -0.876e-8■■■■■ 30.9
AARSP49588 MBNL1-212ENST00000464596 989 ntTSL 59.4□□□□□ -0.96e-8■■■■■ 30.9
AARSP49588 TBC1D5-220ENST00000446863 557 ntTSL 48.93□□□□□ -0.986e-8■■■■■ 30.9
AARSP49588 MBNL1-221ENST00000495875 545 ntTSL 28.9□□□□□ -0.986e-8■■■■■ 30.9
AARSP49588 TBC1D5-209ENST00000429383 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -16e-8■■■■■ 30.9
AARSP49588 ATP11A-205ENST00000419448 435 ntTSL 38.58□□□□□ -1.046e-8■■■■■ 30.9
AARSP49588 ARHGAP11B-202ENST00000562954 652 ntTSL 38.28□□□□□ -1.086e-8■■■■■ 30.9
AARSP49588 CSNK1A1-204ENST00000504676 1772 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.166e-8■■■■■ 30.9
AARSP49588 CSNK1A1-205ENST00000515435 1856 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.176e-8■■■■■ 30.9
AARSP49588 MBNL1-213ENST00000465907 945 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.186e-8■■■■■ 30.9
AARSP49588 MBNL1-219ENST00000492948 1054 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.256e-8■■■■■ 30.9
AARSP49588 MBNL1-217ENST00000485509 1023 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.256e-8■■■■■ 30.9
AARSP49588 CSNK1A1-207ENST00000515768 1098 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.286e-8■■■■■ 30.9
AARSP49588 MBNL1-204ENST00000324210 5465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.36e-8■■■■■ 30.9
AARSP49588 TBC1D5-214ENST00000443386 561 ntTSL 46.74□□□□□ -1.336e-8■■■■■ 30.9
AARSP49588 TBC1D5-217ENST00000444756 545 ntTSL 46.74□□□□□ -1.336e-8■■■■■ 30.9
AARSP49588 TBC1D5-201ENST00000253692 7854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.356e-8■■■■■ 30.9
AARSP49588 TBC1D5-228ENST00000486224 526 ntTSL 36.43□□□□□ -1.386e-8■■■■■ 30.9
AARSP49588 TBC1D5-230ENST00000507877 578 ntTSL 46.16□□□□□ -1.426e-8■■■■■ 30.9
AARSP49588 MBNL1-203ENST00000324196 5225 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.476e-8■■■■■ 30.9
AARSP49588 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.686e-8■■■■■ 30.9
AARSP49588 MBNL1-211ENST00000463374 5092 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.716e-8■■■■■ 30.9
AARSP49588 TBC1D5-213ENST00000434420 386 ntTSL 44.19□□□□□ -1.746e-8■■■■■ 30.9
AARSP49588 MBNL1-218ENST00000485910 4257 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.756e-8■■■■■ 30.9
AARSP49588 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.796e-8■■■■■ 30.9
AARSP49588 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.826e-8■■■■■ 30.9
AARSP49588 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.826e-8■■■■■ 30.9
AARSP49588 TBC1D5-212ENST00000433533 471 ntTSL 33.49□□□□□ -1.856e-8■■■■■ 30.9
AARSP49588 TBC1D5-225ENST00000480435 560 ntTSL 52.61□□□□□ -1.996e-8■■■■■ 30.9
AARSP49588 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.724e-6■■■■■ 30.7
AARSP49588 CHCHD3-202ENST00000423635 1310 ntTSL 1 (best)18.25■□□□□ 0.514e-6■■■■■ 30.7
AARSP49588 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.464e-6■■■■■ 30.7
AARSP49588 CHCHD3-206ENST00000496427 721 ntTSL 57.52□□□□□ -1.214e-6■■■■■ 30.7
AARSP49588 CBX4-203ENST00000494546 432 ntTSL 336■■■■□ 3.354e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.964e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.584e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.464e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.464e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 TBX1-205ENST00000484336 529 ntTSL 329.81■■■□□ 2.364e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.314e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 CCNG2-203ENST00000497512 2051 ntTSL 1 (best)29.21■■■□□ 2.273e-11■■■■■ 30.6
AARSP49588 STK25-209ENST00000424537 781 ntTSL 228.03■■■□□ 2.084e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.94e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 YY1-203ENST00000554371 636 ntTSL 326.72■■□□□ 1.874e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.774e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 NOL4L-209ENST00000485364 885 ntTSL 1 (best)26.05■■□□□ 1.764e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 NOL4L-201ENST00000201961 971 ntAPPRIS ALT2 TSL 325.8■■□□□ 1.724e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 MAP3K10-207ENST00000597986 2104 ntTSL 525.4■■□□□ 1.664e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.644e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 EEF1D-241ENST00000531931 614 ntTSL 324.96■■□□□ 1.594e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 EEF1D-217ENST00000526786 1246 ntTSL 224.96■■□□□ 1.594e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.564e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.523e-11■■■■■ 30.6
AARSP49588 EEF1D-212ENST00000525695 907 ntTSL 524.38■■□□□ 1.494e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.494e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.474e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 SCARB1-206ENST00000539320 720 ntTSL 224.13■■□□□ 1.454e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.444e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 PKN1-207ENST00000586557 899 ntTSL 524■■□□□ 1.434e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 WDR1-209ENST00000505851 715 ntTSL 223.85■■□□□ 1.414e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.384e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.284e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 SCARB1-210ENST00000545493 581 ntTSL 222.99■■□□□ 1.274e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.244e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.223e-11■■■■■ 30.6
AARSP49588 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.224e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.197e-8■■■■■ 30.6
AARSP49588 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.184e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 EEF1D-216ENST00000526710 996 ntTSL 222.34■■□□□ 1.174e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.164e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 STK25-213ENST00000436402 600 ntTSL 522.22■■□□□ 1.154e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 GNB1L-204ENST00000453108 702 ntTSL 322.15■■□□□ 1.147e-8■■■■■ 30.6
AARSP49588 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.134e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 TSPAN32-211ENST00000484104 725 ntTSL 222.04■■□□□ 1.124e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 FAM207A-203ENST00000458015 643 ntTSL 521.81■■□□□ 1.084e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 STK25-229ENST00000492127 1153 ntTSL 221.79■■□□□ 1.084e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.084e-6■■■■■ 30.6
AARSP49588 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.064e-6■■■■■ 30.6
Retrieved 100 of 8,200 protein–RNA pairs in 70.5 ms