Protein–RNA interactions for Protein: P49247

RPIA, Ribose-5-phosphate isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPIAP49247 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RPIAP49247 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RPIAP49247 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RPIAP49247 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RPIAP49247 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPIAP49247 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPIAP49247 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPIAP49247 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPIAP49247 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPIAP49247 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPIAP49247 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPIAP49247 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPIAP49247 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPIAP49247 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPIAP49247 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPIAP49247 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPIAP49247 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPIAP49247 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPIAP49247 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPIAP49247 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPIAP49247 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPIAP49247 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPIAP49247 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPIAP49247 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPIAP49247 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPIAP49247 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPIAP49247 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPIAP49247 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPIAP49247 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPIAP49247 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPIAP49247 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPIAP49247 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPIAP49247 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPIAP49247 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPIAP49247 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPIAP49247 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPIAP49247 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPIAP49247 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RPIAP49247 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPIAP49247 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPIAP49247 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPIAP49247 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPIAP49247 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPIAP49247 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPIAP49247 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPIAP49247 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPIAP49247 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPIAP49247 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPIAP49247 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
RPIAP49247 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RPIAP49247 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPIAP49247 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPIAP49247 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPIAP49247 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPIAP49247 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPIAP49247 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPIAP49247 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPIAP49247 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPIAP49247 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RPIAP49247 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPIAP49247 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPIAP49247 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPIAP49247 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RPIAP49247 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPIAP49247 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPIAP49247 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RPIAP49247 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPIAP49247 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPIAP49247 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPIAP49247 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPIAP49247 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RPIAP49247 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPIAP49247 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPIAP49247 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPIAP49247 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPIAP49247 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPIAP49247 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPIAP49247 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPIAP49247 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPIAP49247 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPIAP49247 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPIAP49247 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPIAP49247 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPIAP49247 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPIAP49247 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPIAP49247 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPIAP49247 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPIAP49247 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPIAP49247 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPIAP49247 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPIAP49247 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPIAP49247 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPIAP49247 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPIAP49247 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RPIAP49247 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPIAP49247 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPIAP49247 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPIAP49247 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPIAP49247 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPIAP49247 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms