Protein–RNA interactions for Protein: P48742

LHX1, LIM/homeobox protein Lhx1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX1P48742 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
LHX1P48742 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LHX1P48742 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LHX1P48742 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LHX1P48742 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LHX1P48742 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LHX1P48742 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LHX1P48742 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LHX1P48742 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LHX1P48742 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LHX1P48742 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LHX1P48742 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LHX1P48742 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LHX1P48742 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LHX1P48742 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LHX1P48742 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LHX1P48742 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LHX1P48742 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LHX1P48742 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LHX1P48742 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LHX1P48742 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LHX1P48742 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LHX1P48742 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LHX1P48742 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LHX1P48742 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LHX1P48742 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LHX1P48742 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LHX1P48742 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LHX1P48742 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LHX1P48742 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LHX1P48742 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LHX1P48742 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LHX1P48742 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LHX1P48742 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LHX1P48742 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LHX1P48742 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LHX1P48742 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LHX1P48742 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LHX1P48742 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LHX1P48742 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LHX1P48742 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LHX1P48742 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LHX1P48742 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LHX1P48742 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LHX1P48742 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LHX1P48742 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LHX1P48742 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LHX1P48742 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LHX1P48742 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LHX1P48742 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LHX1P48742 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LHX1P48742 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LHX1P48742 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LHX1P48742 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LHX1P48742 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LHX1P48742 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LHX1P48742 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LHX1P48742 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LHX1P48742 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LHX1P48742 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LHX1P48742 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LHX1P48742 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LHX1P48742 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LHX1P48742 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LHX1P48742 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LHX1P48742 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LHX1P48742 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LHX1P48742 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LHX1P48742 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LHX1P48742 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LHX1P48742 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
LHX1P48742 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LHX1P48742 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LHX1P48742 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LHX1P48742 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LHX1P48742 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LHX1P48742 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LHX1P48742 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LHX1P48742 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LHX1P48742 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LHX1P48742 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LHX1P48742 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LHX1P48742 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LHX1P48742 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LHX1P48742 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LHX1P48742 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LHX1P48742 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LHX1P48742 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LHX1P48742 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LHX1P48742 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LHX1P48742 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LHX1P48742 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LHX1P48742 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LHX1P48742 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LHX1P48742 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LHX1P48742 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
LHX1P48742 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LHX1P48742 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LHX1P48742 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LHX1P48742 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms