Protein–RNA interactions for Protein: P46013

MKI67, Proliferation marker protein Ki-67, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKI67P46013 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MKI67P46013 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MKI67P46013 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
MKI67P46013 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MKI67P46013 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MKI67P46013 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MKI67P46013 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MKI67P46013 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MKI67P46013 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MKI67P46013 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MKI67P46013 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MKI67P46013 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MKI67P46013 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MKI67P46013 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MKI67P46013 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MKI67P46013 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MKI67P46013 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MKI67P46013 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MKI67P46013 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MKI67P46013 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
MKI67P46013 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MKI67P46013 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MKI67P46013 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MKI67P46013 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MKI67P46013 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MKI67P46013 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MKI67P46013 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MKI67P46013 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MKI67P46013 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MKI67P46013 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MKI67P46013 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MKI67P46013 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MKI67P46013 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MKI67P46013 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MKI67P46013 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MKI67P46013 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MKI67P46013 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MKI67P46013 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MKI67P46013 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
MKI67P46013 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MKI67P46013 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MKI67P46013 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MKI67P46013 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MKI67P46013 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MKI67P46013 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
MKI67P46013 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MKI67P46013 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MKI67P46013 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MKI67P46013 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MKI67P46013 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MKI67P46013 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MKI67P46013 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MKI67P46013 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MKI67P46013 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
MKI67P46013 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MKI67P46013 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MKI67P46013 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MKI67P46013 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MKI67P46013 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MKI67P46013 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MKI67P46013 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MKI67P46013 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MKI67P46013 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MKI67P46013 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MKI67P46013 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MKI67P46013 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MKI67P46013 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MKI67P46013 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MKI67P46013 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MKI67P46013 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MKI67P46013 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MKI67P46013 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MKI67P46013 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MKI67P46013 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MKI67P46013 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MKI67P46013 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MKI67P46013 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MKI67P46013 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
MKI67P46013 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MKI67P46013 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MKI67P46013 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MKI67P46013 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MKI67P46013 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
MKI67P46013 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MKI67P46013 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MKI67P46013 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MKI67P46013 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
MKI67P46013 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MKI67P46013 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
MKI67P46013 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MKI67P46013 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
MKI67P46013 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MKI67P46013 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MKI67P46013 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MKI67P46013 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MKI67P46013 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MKI67P46013 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MKI67P46013 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MKI67P46013 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MKI67P46013 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms