Protein–RNA interactions for Protein: P40121

CAPG, Macrophage-capping protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPGP40121 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CAPGP40121 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CAPGP40121 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CAPGP40121 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CAPGP40121 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CAPGP40121 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CAPGP40121 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CAPGP40121 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CAPGP40121 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CAPGP40121 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CAPGP40121 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAPGP40121 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAPGP40121 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAPGP40121 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAPGP40121 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAPGP40121 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAPGP40121 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAPGP40121 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAPGP40121 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAPGP40121 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAPGP40121 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAPGP40121 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAPGP40121 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAPGP40121 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAPGP40121 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAPGP40121 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAPGP40121 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAPGP40121 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAPGP40121 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAPGP40121 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAPGP40121 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAPGP40121 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAPGP40121 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAPGP40121 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAPGP40121 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAPGP40121 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAPGP40121 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAPGP40121 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAPGP40121 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAPGP40121 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAPGP40121 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAPGP40121 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAPGP40121 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAPGP40121 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAPGP40121 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAPGP40121 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAPGP40121 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAPGP40121 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAPGP40121 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAPGP40121 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAPGP40121 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CAPGP40121 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CAPGP40121 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CAPGP40121 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CAPGP40121 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CAPGP40121 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CAPGP40121 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CAPGP40121 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CAPGP40121 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CAPGP40121 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CAPGP40121 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CAPGP40121 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CAPGP40121 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CAPGP40121 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CAPGP40121 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CAPGP40121 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CAPGP40121 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CAPGP40121 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CAPGP40121 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CAPGP40121 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CAPGP40121 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CAPGP40121 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CAPGP40121 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CAPGP40121 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CAPGP40121 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CAPGP40121 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CAPGP40121 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CAPGP40121 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CAPGP40121 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CAPGP40121 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CAPGP40121 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CAPGP40121 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CAPGP40121 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CAPGP40121 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CAPGP40121 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CAPGP40121 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CAPGP40121 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CAPGP40121 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CAPGP40121 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CAPGP40121 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CAPGP40121 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CAPGP40121 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CAPGP40121 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CAPGP40121 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CAPGP40121 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CAPGP40121 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAPGP40121 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAPGP40121 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAPGP40121 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAPGP40121 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms