Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GGCXP38435 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GGCXP38435 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GGCXP38435 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GGCXP38435 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GGCXP38435 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GGCXP38435 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GGCXP38435 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GGCXP38435 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GGCXP38435 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GGCXP38435 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
GGCXP38435 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GGCXP38435 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GGCXP38435 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GGCXP38435 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GGCXP38435 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GGCXP38435 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GGCXP38435 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GGCXP38435 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GGCXP38435 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GGCXP38435 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GGCXP38435 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GGCXP38435 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GGCXP38435 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GGCXP38435 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GGCXP38435 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GGCXP38435 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GGCXP38435 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GGCXP38435 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GGCXP38435 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GGCXP38435 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GGCXP38435 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GGCXP38435 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GGCXP38435 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GGCXP38435 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GGCXP38435 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GGCXP38435 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GGCXP38435 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GGCXP38435 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GGCXP38435 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GGCXP38435 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GGCXP38435 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GGCXP38435 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GGCXP38435 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GGCXP38435 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GGCXP38435 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GGCXP38435 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GGCXP38435 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GGCXP38435 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GGCXP38435 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GGCXP38435 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GGCXP38435 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GGCXP38435 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GGCXP38435 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GGCXP38435 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GGCXP38435 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GGCXP38435 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GGCXP38435 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GGCXP38435 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GGCXP38435 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GGCXP38435 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GGCXP38435 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GGCXP38435 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GGCXP38435 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GGCXP38435 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GGCXP38435 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GGCXP38435 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GGCXP38435 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GGCXP38435 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GGCXP38435 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GGCXP38435 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GGCXP38435 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GGCXP38435 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
GGCXP38435 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GGCXP38435 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GGCXP38435 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GGCXP38435 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GGCXP38435 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GGCXP38435 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GGCXP38435 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GGCXP38435 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
GGCXP38435 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GGCXP38435 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GGCXP38435 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GGCXP38435 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GGCXP38435 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GGCXP38435 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GGCXP38435 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GGCXP38435 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GGCXP38435 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GGCXP38435 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GGCXP38435 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GGCXP38435 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GGCXP38435 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GGCXP38435 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GGCXP38435 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GGCXP38435 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GGCXP38435 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GGCXP38435 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GGCXP38435 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms