Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP5C1P36542 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP5C1P36542 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP5C1P36542 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP5C1P36542 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP5C1P36542 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP5C1P36542 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP5C1P36542 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP5C1P36542 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP5C1P36542 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP5C1P36542 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP5C1P36542 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP5C1P36542 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP5C1P36542 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP5C1P36542 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP5C1P36542 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP5C1P36542 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP5C1P36542 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP5C1P36542 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP5C1P36542 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP5C1P36542 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP5C1P36542 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP5C1P36542 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP5C1P36542 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP5C1P36542 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP5C1P36542 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP5C1P36542 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP5C1P36542 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP5C1P36542 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP5C1P36542 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP5C1P36542 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP5C1P36542 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP5C1P36542 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP5C1P36542 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP5C1P36542 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP5C1P36542 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP5C1P36542 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP5C1P36542 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP5C1P36542 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP5C1P36542 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP5C1P36542 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP5C1P36542 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP5C1P36542 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP5C1P36542 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP5C1P36542 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP5C1P36542 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP5C1P36542 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP5C1P36542 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP5C1P36542 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP5C1P36542 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP5C1P36542 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP5C1P36542 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP5C1P36542 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP5C1P36542 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP5C1P36542 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP5C1P36542 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP5C1P36542 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP5C1P36542 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATP5C1P36542 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP5C1P36542 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP5C1P36542 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP5C1P36542 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP5C1P36542 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP5C1P36542 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP5C1P36542 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP5C1P36542 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP5C1P36542 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP5C1P36542 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP5C1P36542 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP5C1P36542 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP5C1P36542 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP5C1P36542 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP5C1P36542 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP5C1P36542 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP5C1P36542 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP5C1P36542 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP5C1P36542 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP5C1P36542 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP5C1P36542 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP5C1P36542 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP5C1P36542 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP5C1P36542 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP5C1P36542 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP5C1P36542 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP5C1P36542 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP5C1P36542 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP5C1P36542 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP5C1P36542 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP5C1P36542 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP5C1P36542 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP5C1P36542 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP5C1P36542 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP5C1P36542 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP5C1P36542 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP5C1P36542 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP5C1P36542 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP5C1P36542 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP5C1P36542 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP5C1P36542 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP5C1P36542 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms