Protein–RNA interactions for Protein: P35241

RDX, Radixin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDXP35241 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RDXP35241 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RDXP35241 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RDXP35241 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RDXP35241 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RDXP35241 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RDXP35241 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RDXP35241 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RDXP35241 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RDXP35241 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RDXP35241 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RDXP35241 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RDXP35241 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RDXP35241 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RDXP35241 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RDXP35241 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RDXP35241 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RDXP35241 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RDXP35241 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RDXP35241 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RDXP35241 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RDXP35241 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RDXP35241 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RDXP35241 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RDXP35241 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RDXP35241 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RDXP35241 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RDXP35241 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RDXP35241 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RDXP35241 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RDXP35241 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RDXP35241 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RDXP35241 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RDXP35241 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RDXP35241 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RDXP35241 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RDXP35241 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RDXP35241 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RDXP35241 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RDXP35241 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RDXP35241 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RDXP35241 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RDXP35241 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RDXP35241 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RDXP35241 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RDXP35241 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RDXP35241 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RDXP35241 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RDXP35241 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RDXP35241 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RDXP35241 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RDXP35241 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RDXP35241 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RDXP35241 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RDXP35241 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RDXP35241 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RDXP35241 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RDXP35241 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RDXP35241 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RDXP35241 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RDXP35241 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RDXP35241 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RDXP35241 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RDXP35241 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RDXP35241 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RDXP35241 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RDXP35241 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RDXP35241 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RDXP35241 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RDXP35241 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RDXP35241 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RDXP35241 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RDXP35241 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RDXP35241 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RDXP35241 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RDXP35241 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RDXP35241 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RDXP35241 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RDXP35241 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RDXP35241 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RDXP35241 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RDXP35241 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RDXP35241 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RDXP35241 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RDXP35241 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RDXP35241 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RDXP35241 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RDXP35241 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RDXP35241 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RDXP35241 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RDXP35241 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RDXP35241 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RDXP35241 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RDXP35241 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RDXP35241 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RDXP35241 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RDXP35241 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RDXP35241 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RDXP35241 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RDXP35241 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms