Protein–RNA interactions for Protein: P33241

LSP1, Lymphocyte-specific protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSP1P33241 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LSP1P33241 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LSP1P33241 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LSP1P33241 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LSP1P33241 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LSP1P33241 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LSP1P33241 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LSP1P33241 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LSP1P33241 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LSP1P33241 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LSP1P33241 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LSP1P33241 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LSP1P33241 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LSP1P33241 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LSP1P33241 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LSP1P33241 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LSP1P33241 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LSP1P33241 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LSP1P33241 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LSP1P33241 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LSP1P33241 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LSP1P33241 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LSP1P33241 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LSP1P33241 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LSP1P33241 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LSP1P33241 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LSP1P33241 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LSP1P33241 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LSP1P33241 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LSP1P33241 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LSP1P33241 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LSP1P33241 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LSP1P33241 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LSP1P33241 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LSP1P33241 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LSP1P33241 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LSP1P33241 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LSP1P33241 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LSP1P33241 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LSP1P33241 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LSP1P33241 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LSP1P33241 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LSP1P33241 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LSP1P33241 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LSP1P33241 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LSP1P33241 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LSP1P33241 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LSP1P33241 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LSP1P33241 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LSP1P33241 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LSP1P33241 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LSP1P33241 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LSP1P33241 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LSP1P33241 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LSP1P33241 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LSP1P33241 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LSP1P33241 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LSP1P33241 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LSP1P33241 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LSP1P33241 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LSP1P33241 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LSP1P33241 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LSP1P33241 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LSP1P33241 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LSP1P33241 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LSP1P33241 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LSP1P33241 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LSP1P33241 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LSP1P33241 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LSP1P33241 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LSP1P33241 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LSP1P33241 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LSP1P33241 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LSP1P33241 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LSP1P33241 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LSP1P33241 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LSP1P33241 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LSP1P33241 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LSP1P33241 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LSP1P33241 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LSP1P33241 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LSP1P33241 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LSP1P33241 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LSP1P33241 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LSP1P33241 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LSP1P33241 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LSP1P33241 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LSP1P33241 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LSP1P33241 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LSP1P33241 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LSP1P33241 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LSP1P33241 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LSP1P33241 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LSP1P33241 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LSP1P33241 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LSP1P33241 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LSP1P33241 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LSP1P33241 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LSP1P33241 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LSP1P33241 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms