Protein–RNA interactions for Protein: P32247

BRS3, Bombesin receptor subtype-3, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRS3P32247 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
BRS3P32247 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRS3P32247 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRS3P32247 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRS3P32247 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRS3P32247 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRS3P32247 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRS3P32247 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
BRS3P32247 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRS3P32247 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRS3P32247 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRS3P32247 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRS3P32247 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRS3P32247 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRS3P32247 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRS3P32247 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRS3P32247 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRS3P32247 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRS3P32247 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRS3P32247 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRS3P32247 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRS3P32247 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
BRS3P32247 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRS3P32247 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRS3P32247 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRS3P32247 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRS3P32247 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRS3P32247 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRS3P32247 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BRS3P32247 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BRS3P32247 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
BRS3P32247 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BRS3P32247 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BRS3P32247 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BRS3P32247 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BRS3P32247 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BRS3P32247 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BRS3P32247 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BRS3P32247 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRS3P32247 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRS3P32247 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRS3P32247 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRS3P32247 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRS3P32247 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRS3P32247 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRS3P32247 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRS3P32247 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
BRS3P32247 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRS3P32247 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRS3P32247 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRS3P32247 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
BRS3P32247 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
BRS3P32247 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRS3P32247 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRS3P32247 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRS3P32247 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRS3P32247 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRS3P32247 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRS3P32247 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRS3P32247 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRS3P32247 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRS3P32247 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BRS3P32247 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BRS3P32247 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BRS3P32247 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BRS3P32247 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BRS3P32247 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BRS3P32247 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
BRS3P32247 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
BRS3P32247 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
BRS3P32247 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
BRS3P32247 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
BRS3P32247 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BRS3P32247 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BRS3P32247 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BRS3P32247 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BRS3P32247 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
BRS3P32247 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BRS3P32247 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BRS3P32247 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BRS3P32247 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BRS3P32247 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BRS3P32247 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BRS3P32247 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
BRS3P32247 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
BRS3P32247 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BRS3P32247 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BRS3P32247 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BRS3P32247 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
BRS3P32247 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BRS3P32247 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BRS3P32247 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BRS3P32247 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BRS3P32247 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
BRS3P32247 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BRS3P32247 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BRS3P32247 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BRS3P32247 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BRS3P32247 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BRS3P32247 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms