Protein–RNA interactions for Protein: P30038

ALDH4A1, Delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH4A1P30038 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALDH4A1P30038 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALDH4A1P30038 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALDH4A1P30038 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALDH4A1P30038 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ALDH4A1P30038 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ALDH4A1P30038 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ALDH4A1P30038 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ALDH4A1P30038 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ALDH4A1P30038 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ALDH4A1P30038 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ALDH4A1P30038 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ALDH4A1P30038 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ALDH4A1P30038 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ALDH4A1P30038 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ALDH4A1P30038 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ALDH4A1P30038 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ALDH4A1P30038 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ALDH4A1P30038 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ALDH4A1P30038 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ALDH4A1P30038 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ALDH4A1P30038 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ALDH4A1P30038 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ALDH4A1P30038 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ALDH4A1P30038 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ALDH4A1P30038 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ALDH4A1P30038 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ALDH4A1P30038 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ALDH4A1P30038 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ALDH4A1P30038 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ALDH4A1P30038 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ALDH4A1P30038 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ALDH4A1P30038 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ALDH4A1P30038 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ALDH4A1P30038 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ALDH4A1P30038 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ALDH4A1P30038 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ALDH4A1P30038 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ALDH4A1P30038 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ALDH4A1P30038 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ALDH4A1P30038 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ALDH4A1P30038 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ALDH4A1P30038 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ALDH4A1P30038 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ALDH4A1P30038 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ALDH4A1P30038 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ALDH4A1P30038 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ALDH4A1P30038 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ALDH4A1P30038 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ALDH4A1P30038 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ALDH4A1P30038 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ALDH4A1P30038 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ALDH4A1P30038 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ALDH4A1P30038 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ALDH4A1P30038 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ALDH4A1P30038 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ALDH4A1P30038 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ALDH4A1P30038 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALDH4A1P30038 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALDH4A1P30038 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALDH4A1P30038 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALDH4A1P30038 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALDH4A1P30038 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALDH4A1P30038 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALDH4A1P30038 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALDH4A1P30038 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALDH4A1P30038 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALDH4A1P30038 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALDH4A1P30038 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALDH4A1P30038 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALDH4A1P30038 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALDH4A1P30038 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ALDH4A1P30038 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ALDH4A1P30038 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ALDH4A1P30038 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ALDH4A1P30038 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ALDH4A1P30038 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ALDH4A1P30038 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ALDH4A1P30038 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ALDH4A1P30038 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ALDH4A1P30038 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ALDH4A1P30038 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ALDH4A1P30038 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ALDH4A1P30038 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ALDH4A1P30038 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ALDH4A1P30038 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ALDH4A1P30038 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ALDH4A1P30038 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ALDH4A1P30038 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ALDH4A1P30038 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ALDH4A1P30038 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ALDH4A1P30038 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ALDH4A1P30038 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ALDH4A1P30038 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ALDH4A1P30038 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ALDH4A1P30038 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ALDH4A1P30038 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ALDH4A1P30038 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ALDH4A1P30038 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ALDH4A1P30038 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms