Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CNGA1P29973 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNGA1P29973 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNGA1P29973 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNGA1P29973 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNGA1P29973 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNGA1P29973 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNGA1P29973 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNGA1P29973 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CNGA1P29973 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CNGA1P29973 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNGA1P29973 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNGA1P29973 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNGA1P29973 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNGA1P29973 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNGA1P29973 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNGA1P29973 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNGA1P29973 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNGA1P29973 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNGA1P29973 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNGA1P29973 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNGA1P29973 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNGA1P29973 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNGA1P29973 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CNGA1P29973 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNGA1P29973 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNGA1P29973 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNGA1P29973 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNGA1P29973 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNGA1P29973 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNGA1P29973 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNGA1P29973 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNGA1P29973 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNGA1P29973 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNGA1P29973 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNGA1P29973 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNGA1P29973 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CNGA1P29973 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNGA1P29973 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNGA1P29973 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CNGA1P29973 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CNGA1P29973 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CNGA1P29973 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CNGA1P29973 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CNGA1P29973 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CNGA1P29973 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CNGA1P29973 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CNGA1P29973 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CNGA1P29973 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CNGA1P29973 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
CNGA1P29973 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CNGA1P29973 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CNGA1P29973 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNGA1P29973 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNGA1P29973 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNGA1P29973 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNGA1P29973 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNGA1P29973 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNGA1P29973 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNGA1P29973 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNGA1P29973 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNGA1P29973 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNGA1P29973 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNGA1P29973 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNGA1P29973 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNGA1P29973 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNGA1P29973 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNGA1P29973 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNGA1P29973 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CNGA1P29973 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNGA1P29973 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNGA1P29973 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNGA1P29973 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNGA1P29973 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNGA1P29973 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNGA1P29973 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNGA1P29973 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNGA1P29973 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNGA1P29973 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNGA1P29973 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNGA1P29973 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNGA1P29973 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNGA1P29973 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNGA1P29973 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNGA1P29973 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNGA1P29973 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNGA1P29973 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNGA1P29973 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CNGA1P29973 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CNGA1P29973 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNGA1P29973 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNGA1P29973 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNGA1P29973 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNGA1P29973 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNGA1P29973 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNGA1P29973 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNGA1P29973 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNGA1P29973 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNGA1P29973 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CNGA1P29973 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.2 ms