Protein–RNA interactions for Protein: P23677

ITPKA, Inositol-trisphosphate 3-kinase A, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITPKAP23677 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITPKAP23677 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITPKAP23677 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITPKAP23677 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITPKAP23677 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITPKAP23677 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ITPKAP23677 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITPKAP23677 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITPKAP23677 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITPKAP23677 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITPKAP23677 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITPKAP23677 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITPKAP23677 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITPKAP23677 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITPKAP23677 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITPKAP23677 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITPKAP23677 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITPKAP23677 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITPKAP23677 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITPKAP23677 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITPKAP23677 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITPKAP23677 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITPKAP23677 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITPKAP23677 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITPKAP23677 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITPKAP23677 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITPKAP23677 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITPKAP23677 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITPKAP23677 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITPKAP23677 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITPKAP23677 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITPKAP23677 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITPKAP23677 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITPKAP23677 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITPKAP23677 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITPKAP23677 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITPKAP23677 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITPKAP23677 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITPKAP23677 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ITPKAP23677 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITPKAP23677 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITPKAP23677 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITPKAP23677 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITPKAP23677 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITPKAP23677 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITPKAP23677 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITPKAP23677 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITPKAP23677 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITPKAP23677 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITPKAP23677 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITPKAP23677 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITPKAP23677 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITPKAP23677 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITPKAP23677 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITPKAP23677 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITPKAP23677 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITPKAP23677 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITPKAP23677 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITPKAP23677 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITPKAP23677 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITPKAP23677 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITPKAP23677 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITPKAP23677 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ITPKAP23677 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITPKAP23677 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITPKAP23677 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITPKAP23677 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITPKAP23677 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITPKAP23677 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITPKAP23677 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITPKAP23677 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITPKAP23677 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITPKAP23677 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ITPKAP23677 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITPKAP23677 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITPKAP23677 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITPKAP23677 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITPKAP23677 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITPKAP23677 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITPKAP23677 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITPKAP23677 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITPKAP23677 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITPKAP23677 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITPKAP23677 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITPKAP23677 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITPKAP23677 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITPKAP23677 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITPKAP23677 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITPKAP23677 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITPKAP23677 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITPKAP23677 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITPKAP23677 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITPKAP23677 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITPKAP23677 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITPKAP23677 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITPKAP23677 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITPKAP23677 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITPKAP23677 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITPKAP23677 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITPKAP23677 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms