Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRDP23468 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRDP23468 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRDP23468 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRDP23468 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRDP23468 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRDP23468 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRDP23468 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRDP23468 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRDP23468 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRDP23468 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRDP23468 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRDP23468 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRDP23468 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRDP23468 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRDP23468 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRDP23468 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRDP23468 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRDP23468 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRDP23468 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRDP23468 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRDP23468 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRDP23468 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRDP23468 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRDP23468 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRDP23468 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRDP23468 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRDP23468 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRDP23468 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRDP23468 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRDP23468 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRDP23468 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRDP23468 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRDP23468 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRDP23468 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRDP23468 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRDP23468 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRDP23468 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRDP23468 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRDP23468 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRDP23468 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRDP23468 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRDP23468 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRDP23468 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRDP23468 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRDP23468 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRDP23468 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRDP23468 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRDP23468 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRDP23468 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRDP23468 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRDP23468 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRDP23468 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRDP23468 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRDP23468 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRDP23468 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRDP23468 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRDP23468 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRDP23468 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRDP23468 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRDP23468 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRDP23468 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRDP23468 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRDP23468 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRDP23468 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRDP23468 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRDP23468 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRDP23468 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRDP23468 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRDP23468 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRDP23468 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRDP23468 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRDP23468 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRDP23468 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRDP23468 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRDP23468 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRDP23468 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRDP23468 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRDP23468 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRDP23468 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRDP23468 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRDP23468 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRDP23468 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRDP23468 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRDP23468 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRDP23468 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRDP23468 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRDP23468 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRDP23468 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRDP23468 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRDP23468 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRDP23468 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRDP23468 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRDP23468 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRDP23468 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRDP23468 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRDP23468 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRDP23468 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRDP23468 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRDP23468 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
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