Protein–RNA interactions for Protein: P21399

ACO1, Cytoplasmic aconitate hydratase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 889 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACO1P21399 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACO1P21399 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACO1P21399 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACO1P21399 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACO1P21399 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACO1P21399 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACO1P21399 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACO1P21399 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ACO1P21399 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ACO1P21399 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACO1P21399 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACO1P21399 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACO1P21399 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACO1P21399 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACO1P21399 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACO1P21399 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACO1P21399 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACO1P21399 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACO1P21399 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACO1P21399 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ACO1P21399 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACO1P21399 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACO1P21399 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACO1P21399 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACO1P21399 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACO1P21399 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACO1P21399 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACO1P21399 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ACO1P21399 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ACO1P21399 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACO1P21399 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ACO1P21399 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACO1P21399 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACO1P21399 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACO1P21399 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACO1P21399 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACO1P21399 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACO1P21399 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACO1P21399 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACO1P21399 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACO1P21399 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACO1P21399 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACO1P21399 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACO1P21399 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ACO1P21399 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACO1P21399 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ACO1P21399 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACO1P21399 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACO1P21399 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACO1P21399 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACO1P21399 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACO1P21399 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACO1P21399 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACO1P21399 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACO1P21399 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ACO1P21399 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACO1P21399 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACO1P21399 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACO1P21399 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ACO1P21399 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ACO1P21399 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ACO1P21399 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ACO1P21399 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ACO1P21399 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ACO1P21399 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ACO1P21399 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ACO1P21399 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ACO1P21399 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ACO1P21399 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ACO1P21399 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
ACO1P21399 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ACO1P21399 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ACO1P21399 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACO1P21399 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACO1P21399 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ACO1P21399 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACO1P21399 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACO1P21399 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACO1P21399 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACO1P21399 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACO1P21399 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACO1P21399 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACO1P21399 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACO1P21399 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACO1P21399 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACO1P21399 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACO1P21399 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACO1P21399 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACO1P21399 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACO1P21399 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACO1P21399 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACO1P21399 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACO1P21399 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACO1P21399 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACO1P21399 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ACO1P21399 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACO1P21399 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACO1P21399 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACO1P21399 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACO1P21399 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms