Protein–RNA interactions for Protein: P20393

NR1D1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D1P20393 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NR1D1P20393 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NR1D1P20393 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NR1D1P20393 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NR1D1P20393 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NR1D1P20393 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NR1D1P20393 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NR1D1P20393 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NR1D1P20393 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NR1D1P20393 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NR1D1P20393 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NR1D1P20393 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NR1D1P20393 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NR1D1P20393 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NR1D1P20393 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NR1D1P20393 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NR1D1P20393 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NR1D1P20393 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NR1D1P20393 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NR1D1P20393 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NR1D1P20393 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NR1D1P20393 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NR1D1P20393 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NR1D1P20393 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NR1D1P20393 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NR1D1P20393 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NR1D1P20393 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NR1D1P20393 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NR1D1P20393 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NR1D1P20393 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NR1D1P20393 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NR1D1P20393 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NR1D1P20393 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NR1D1P20393 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NR1D1P20393 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NR1D1P20393 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NR1D1P20393 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NR1D1P20393 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NR1D1P20393 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NR1D1P20393 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NR1D1P20393 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NR1D1P20393 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NR1D1P20393 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NR1D1P20393 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NR1D1P20393 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NR1D1P20393 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NR1D1P20393 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NR1D1P20393 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NR1D1P20393 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NR1D1P20393 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NR1D1P20393 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NR1D1P20393 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NR1D1P20393 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NR1D1P20393 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NR1D1P20393 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NR1D1P20393 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NR1D1P20393 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NR1D1P20393 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NR1D1P20393 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NR1D1P20393 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NR1D1P20393 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NR1D1P20393 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NR1D1P20393 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NR1D1P20393 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NR1D1P20393 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NR1D1P20393 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NR1D1P20393 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NR1D1P20393 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NR1D1P20393 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NR1D1P20393 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NR1D1P20393 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NR1D1P20393 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NR1D1P20393 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NR1D1P20393 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NR1D1P20393 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NR1D1P20393 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NR1D1P20393 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NR1D1P20393 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NR1D1P20393 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NR1D1P20393 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NR1D1P20393 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NR1D1P20393 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NR1D1P20393 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NR1D1P20393 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NR1D1P20393 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NR1D1P20393 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NR1D1P20393 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NR1D1P20393 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NR1D1P20393 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NR1D1P20393 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NR1D1P20393 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NR1D1P20393 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NR1D1P20393 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NR1D1P20393 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NR1D1P20393 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NR1D1P20393 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NR1D1P20393 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NR1D1P20393 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NR1D1P20393 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NR1D1P20393 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms