Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CXCL3P19876 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CXCL3P19876 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CXCL3P19876 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CXCL3P19876 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CXCL3P19876 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CXCL3P19876 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CXCL3P19876 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CXCL3P19876 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CXCL3P19876 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CXCL3P19876 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CXCL3P19876 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CXCL3P19876 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CXCL3P19876 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CXCL3P19876 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CXCL3P19876 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CXCL3P19876 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CXCL3P19876 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CXCL3P19876 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CXCL3P19876 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CXCL3P19876 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CXCL3P19876 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CXCL3P19876 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CXCL3P19876 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CXCL3P19876 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CXCL3P19876 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CXCL3P19876 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CXCL3P19876 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CXCL3P19876 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CXCL3P19876 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CXCL3P19876 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CXCL3P19876 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CXCL3P19876 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CXCL3P19876 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CXCL3P19876 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CXCL3P19876 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CXCL3P19876 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CXCL3P19876 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CXCL3P19876 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CXCL3P19876 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CXCL3P19876 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CXCL3P19876 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CXCL3P19876 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CXCL3P19876 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CXCL3P19876 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CXCL3P19876 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CXCL3P19876 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CXCL3P19876 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CXCL3P19876 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CXCL3P19876 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CXCL3P19876 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CXCL3P19876 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CXCL3P19876 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CXCL3P19876 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CXCL3P19876 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CXCL3P19876 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CXCL3P19876 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CXCL3P19876 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CXCL3P19876 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CXCL3P19876 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CXCL3P19876 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CXCL3P19876 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CXCL3P19876 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CXCL3P19876 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CXCL3P19876 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CXCL3P19876 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CXCL3P19876 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CXCL3P19876 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CXCL3P19876 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CXCL3P19876 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CXCL3P19876 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CXCL3P19876 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CXCL3P19876 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CXCL3P19876 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CXCL3P19876 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CXCL3P19876 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CXCL3P19876 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CXCL3P19876 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CXCL3P19876 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CXCL3P19876 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CXCL3P19876 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CXCL3P19876 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CXCL3P19876 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CXCL3P19876 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CXCL3P19876 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CXCL3P19876 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CXCL3P19876 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CXCL3P19876 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CXCL3P19876 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CXCL3P19876 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CXCL3P19876 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CXCL3P19876 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CXCL3P19876 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CXCL3P19876 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CXCL3P19876 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CXCL3P19876 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CXCL3P19876 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CXCL3P19876 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CXCL3P19876 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CXCL3P19876 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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