Protein–RNA interactions for Protein: P19532

TFE3, Transcription factor E3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFE3P19532 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TFE3P19532 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TFE3P19532 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TFE3P19532 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TFE3P19532 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TFE3P19532 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TFE3P19532 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TFE3P19532 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TFE3P19532 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TFE3P19532 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TFE3P19532 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TFE3P19532 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TFE3P19532 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TFE3P19532 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TFE3P19532 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TFE3P19532 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TFE3P19532 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TFE3P19532 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TFE3P19532 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TFE3P19532 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TFE3P19532 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TFE3P19532 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TFE3P19532 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TFE3P19532 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TFE3P19532 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TFE3P19532 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TFE3P19532 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TFE3P19532 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TFE3P19532 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TFE3P19532 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TFE3P19532 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TFE3P19532 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TFE3P19532 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TFE3P19532 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TFE3P19532 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TFE3P19532 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TFE3P19532 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TFE3P19532 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TFE3P19532 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TFE3P19532 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TFE3P19532 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TFE3P19532 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TFE3P19532 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TFE3P19532 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TFE3P19532 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TFE3P19532 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TFE3P19532 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TFE3P19532 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TFE3P19532 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TFE3P19532 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TFE3P19532 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TFE3P19532 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TFE3P19532 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TFE3P19532 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TFE3P19532 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TFE3P19532 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TFE3P19532 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TFE3P19532 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TFE3P19532 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TFE3P19532 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TFE3P19532 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TFE3P19532 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TFE3P19532 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TFE3P19532 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TFE3P19532 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TFE3P19532 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TFE3P19532 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TFE3P19532 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TFE3P19532 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TFE3P19532 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TFE3P19532 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TFE3P19532 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TFE3P19532 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TFE3P19532 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TFE3P19532 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TFE3P19532 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TFE3P19532 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
TFE3P19532 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TFE3P19532 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TFE3P19532 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TFE3P19532 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TFE3P19532 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TFE3P19532 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TFE3P19532 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TFE3P19532 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TFE3P19532 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TFE3P19532 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TFE3P19532 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TFE3P19532 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TFE3P19532 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TFE3P19532 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TFE3P19532 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TFE3P19532 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TFE3P19532 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TFE3P19532 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TFE3P19532 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TFE3P19532 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TFE3P19532 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TFE3P19532 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TFE3P19532 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms