Protein–RNA interactions for Protein: P18146

EGR1, Early growth response protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR1P18146 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
EGR1P18146 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
EGR1P18146 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
EGR1P18146 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
EGR1P18146 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
EGR1P18146 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
EGR1P18146 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
EGR1P18146 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
EGR1P18146 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
EGR1P18146 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
EGR1P18146 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
EGR1P18146 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
EGR1P18146 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
EGR1P18146 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
EGR1P18146 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
EGR1P18146 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
EGR1P18146 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
EGR1P18146 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
EGR1P18146 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
EGR1P18146 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
EGR1P18146 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
EGR1P18146 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
EGR1P18146 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
EGR1P18146 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
EGR1P18146 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
EGR1P18146 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
EGR1P18146 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
EGR1P18146 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
EGR1P18146 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
EGR1P18146 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
EGR1P18146 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
EGR1P18146 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
EGR1P18146 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
EGR1P18146 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
EGR1P18146 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
EGR1P18146 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
EGR1P18146 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
EGR1P18146 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
EGR1P18146 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
EGR1P18146 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
EGR1P18146 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
EGR1P18146 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
EGR1P18146 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
EGR1P18146 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
EGR1P18146 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
EGR1P18146 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
EGR1P18146 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
EGR1P18146 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
EGR1P18146 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
EGR1P18146 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
EGR1P18146 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
EGR1P18146 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
EGR1P18146 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
EGR1P18146 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
EGR1P18146 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
EGR1P18146 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EGR1P18146 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EGR1P18146 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EGR1P18146 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EGR1P18146 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EGR1P18146 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EGR1P18146 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EGR1P18146 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EGR1P18146 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EGR1P18146 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EGR1P18146 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EGR1P18146 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EGR1P18146 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EGR1P18146 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EGR1P18146 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EGR1P18146 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EGR1P18146 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EGR1P18146 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EGR1P18146 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EGR1P18146 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
EGR1P18146 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EGR1P18146 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EGR1P18146 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EGR1P18146 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EGR1P18146 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EGR1P18146 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
EGR1P18146 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EGR1P18146 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EGR1P18146 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EGR1P18146 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EGR1P18146 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EGR1P18146 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EGR1P18146 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EGR1P18146 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EGR1P18146 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EGR1P18146 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EGR1P18146 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EGR1P18146 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EGR1P18146 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EGR1P18146 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EGR1P18146 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EGR1P18146 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
EGR1P18146 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EGR1P18146 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EGR1P18146 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms