Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXB3P14651 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXB3P14651 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXB3P14651 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXB3P14651 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXB3P14651 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXB3P14651 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXB3P14651 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXB3P14651 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXB3P14651 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXB3P14651 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXB3P14651 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXB3P14651 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXB3P14651 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXB3P14651 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXB3P14651 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXB3P14651 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXB3P14651 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXB3P14651 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXB3P14651 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXB3P14651 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXB3P14651 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXB3P14651 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXB3P14651 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXB3P14651 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXB3P14651 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXB3P14651 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXB3P14651 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXB3P14651 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXB3P14651 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXB3P14651 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXB3P14651 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXB3P14651 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXB3P14651 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXB3P14651 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXB3P14651 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXB3P14651 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXB3P14651 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXB3P14651 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXB3P14651 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXB3P14651 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXB3P14651 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXB3P14651 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXB3P14651 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXB3P14651 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXB3P14651 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXB3P14651 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HOXB3P14651 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HOXB3P14651 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HOXB3P14651 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HOXB3P14651 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXB3P14651 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXB3P14651 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXB3P14651 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXB3P14651 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXB3P14651 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXB3P14651 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXB3P14651 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXB3P14651 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXB3P14651 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXB3P14651 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXB3P14651 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXB3P14651 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXB3P14651 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXB3P14651 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXB3P14651 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXB3P14651 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXB3P14651 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXB3P14651 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXB3P14651 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXB3P14651 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXB3P14651 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXB3P14651 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXB3P14651 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXB3P14651 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXB3P14651 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXB3P14651 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXB3P14651 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXB3P14651 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXB3P14651 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXB3P14651 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXB3P14651 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXB3P14651 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXB3P14651 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXB3P14651 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXB3P14651 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXB3P14651 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXB3P14651 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXB3P14651 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXB3P14651 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXB3P14651 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXB3P14651 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXB3P14651 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXB3P14651 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXB3P14651 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXB3P14651 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXB3P14651 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXB3P14651 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXB3P14651 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXB3P14651 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms