Protein–RNA interactions for Protein: P10451

SPP1, Osteopontin, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPP1P10451 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPP1P10451 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPP1P10451 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPP1P10451 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPP1P10451 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPP1P10451 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPP1P10451 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPP1P10451 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPP1P10451 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPP1P10451 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPP1P10451 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPP1P10451 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPP1P10451 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPP1P10451 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPP1P10451 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPP1P10451 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPP1P10451 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPP1P10451 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPP1P10451 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPP1P10451 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPP1P10451 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPP1P10451 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPP1P10451 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPP1P10451 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPP1P10451 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPP1P10451 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPP1P10451 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPP1P10451 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPP1P10451 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPP1P10451 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPP1P10451 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPP1P10451 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPP1P10451 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SPP1P10451 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPP1P10451 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPP1P10451 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPP1P10451 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPP1P10451 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPP1P10451 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPP1P10451 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPP1P10451 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPP1P10451 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPP1P10451 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPP1P10451 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPP1P10451 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPP1P10451 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPP1P10451 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPP1P10451 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SPP1P10451 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPP1P10451 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPP1P10451 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPP1P10451 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPP1P10451 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPP1P10451 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPP1P10451 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPP1P10451 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPP1P10451 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPP1P10451 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPP1P10451 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPP1P10451 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPP1P10451 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPP1P10451 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPP1P10451 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPP1P10451 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPP1P10451 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPP1P10451 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPP1P10451 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPP1P10451 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPP1P10451 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPP1P10451 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPP1P10451 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPP1P10451 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPP1P10451 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPP1P10451 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPP1P10451 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPP1P10451 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPP1P10451 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPP1P10451 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPP1P10451 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPP1P10451 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPP1P10451 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPP1P10451 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPP1P10451 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPP1P10451 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPP1P10451 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPP1P10451 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPP1P10451 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPP1P10451 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPP1P10451 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPP1P10451 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPP1P10451 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPP1P10451 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPP1P10451 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPP1P10451 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPP1P10451 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPP1P10451 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPP1P10451 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPP1P10451 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPP1P10451 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPP1P10451 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms