Protein–RNA interactions for Protein: P0DP01

IGHV1-8, Immunoglobulin heavy variable 1-8, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV1-8P0DP01 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IGHV1-8P0DP01 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IGHV1-8P0DP01 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IGHV1-8P0DP01 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IGHV1-8P0DP01 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IGHV1-8P0DP01 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IGHV1-8P0DP01 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
IGHV1-8P0DP01 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IGHV1-8P0DP01 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IGHV1-8P0DP01 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IGHV1-8P0DP01 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
IGHV1-8P0DP01 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IGHV1-8P0DP01 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IGHV1-8P0DP01 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IGHV1-8P0DP01 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IGHV1-8P0DP01 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IGHV1-8P0DP01 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IGHV1-8P0DP01 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IGHV1-8P0DP01 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IGHV1-8P0DP01 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IGHV1-8P0DP01 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IGHV1-8P0DP01 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IGHV1-8P0DP01 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
IGHV1-8P0DP01 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IGHV1-8P0DP01 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
IGHV1-8P0DP01 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IGHV1-8P0DP01 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IGHV1-8P0DP01 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IGHV1-8P0DP01 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IGHV1-8P0DP01 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IGHV1-8P0DP01 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IGHV1-8P0DP01 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IGHV1-8P0DP01 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IGHV1-8P0DP01 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
IGHV1-8P0DP01 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IGHV1-8P0DP01 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IGHV1-8P0DP01 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IGHV1-8P0DP01 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IGHV1-8P0DP01 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IGHV1-8P0DP01 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IGHV1-8P0DP01 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IGHV1-8P0DP01 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IGHV1-8P0DP01 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IGHV1-8P0DP01 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IGHV1-8P0DP01 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IGHV1-8P0DP01 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IGHV1-8P0DP01 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IGHV1-8P0DP01 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IGHV1-8P0DP01 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IGHV1-8P0DP01 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IGHV1-8P0DP01 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IGHV1-8P0DP01 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IGHV1-8P0DP01 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGHV1-8P0DP01 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGHV1-8P0DP01 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGHV1-8P0DP01 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGHV1-8P0DP01 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGHV1-8P0DP01 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGHV1-8P0DP01 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGHV1-8P0DP01 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGHV1-8P0DP01 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGHV1-8P0DP01 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGHV1-8P0DP01 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGHV1-8P0DP01 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGHV1-8P0DP01 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGHV1-8P0DP01 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
IGHV1-8P0DP01 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGHV1-8P0DP01 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGHV1-8P0DP01 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGHV1-8P0DP01 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGHV1-8P0DP01 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGHV1-8P0DP01 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGHV1-8P0DP01 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGHV1-8P0DP01 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGHV1-8P0DP01 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGHV1-8P0DP01 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGHV1-8P0DP01 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGHV1-8P0DP01 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGHV1-8P0DP01 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGHV1-8P0DP01 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGHV1-8P0DP01 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGHV1-8P0DP01 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGHV1-8P0DP01 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGHV1-8P0DP01 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGHV1-8P0DP01 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IGHV1-8P0DP01 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IGHV1-8P0DP01 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IGHV1-8P0DP01 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IGHV1-8P0DP01 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IGHV1-8P0DP01 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IGHV1-8P0DP01 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IGHV1-8P0DP01 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IGHV1-8P0DP01 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IGHV1-8P0DP01 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
IGHV1-8P0DP01 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
IGHV1-8P0DP01 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
IGHV1-8P0DP01 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
IGHV1-8P0DP01 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
IGHV1-8P0DP01 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
IGHV1-8P0DP01 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.5 ms