Protein–RNA interactions for Protein: P0CW18

PRSS56, Serine protease 56, humanhuman

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRSS56P0CW18 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRSS56P0CW18 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRSS56P0CW18 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRSS56P0CW18 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PRSS56P0CW18 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRSS56P0CW18 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRSS56P0CW18 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRSS56P0CW18 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRSS56P0CW18 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRSS56P0CW18 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRSS56P0CW18 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRSS56P0CW18 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRSS56P0CW18 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRSS56P0CW18 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRSS56P0CW18 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRSS56P0CW18 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRSS56P0CW18 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRSS56P0CW18 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRSS56P0CW18 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRSS56P0CW18 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRSS56P0CW18 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRSS56P0CW18 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRSS56P0CW18 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRSS56P0CW18 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRSS56P0CW18 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRSS56P0CW18 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRSS56P0CW18 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PRSS56P0CW18 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRSS56P0CW18 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRSS56P0CW18 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRSS56P0CW18 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRSS56P0CW18 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRSS56P0CW18 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRSS56P0CW18 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRSS56P0CW18 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PRSS56P0CW18 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRSS56P0CW18 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRSS56P0CW18 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRSS56P0CW18 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRSS56P0CW18 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRSS56P0CW18 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRSS56P0CW18 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRSS56P0CW18 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PRSS56P0CW18 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRSS56P0CW18 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRSS56P0CW18 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PRSS56P0CW18 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRSS56P0CW18 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRSS56P0CW18 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PRSS56P0CW18 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PRSS56P0CW18 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRSS56P0CW18 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRSS56P0CW18 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRSS56P0CW18 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRSS56P0CW18 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRSS56P0CW18 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRSS56P0CW18 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRSS56P0CW18 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRSS56P0CW18 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRSS56P0CW18 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRSS56P0CW18 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRSS56P0CW18 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PRSS56P0CW18 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRSS56P0CW18 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRSS56P0CW18 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRSS56P0CW18 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRSS56P0CW18 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRSS56P0CW18 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRSS56P0CW18 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRSS56P0CW18 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRSS56P0CW18 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRSS56P0CW18 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRSS56P0CW18 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRSS56P0CW18 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRSS56P0CW18 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRSS56P0CW18 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRSS56P0CW18 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRSS56P0CW18 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRSS56P0CW18 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRSS56P0CW18 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRSS56P0CW18 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRSS56P0CW18 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRSS56P0CW18 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRSS56P0CW18 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRSS56P0CW18 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRSS56P0CW18 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRSS56P0CW18 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRSS56P0CW18 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PRSS56P0CW18 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRSS56P0CW18 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRSS56P0CW18 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRSS56P0CW18 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRSS56P0CW18 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRSS56P0CW18 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRSS56P0CW18 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRSS56P0CW18 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRSS56P0CW18 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRSS56P0CW18 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRSS56P0CW18 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRSS56P0CW18 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms