Protein–RNA interactions for Protein: P09874

PARP1, Poly [ADP-ribose] polymerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP1P09874 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PARP1P09874 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PARP1P09874 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PARP1P09874 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PARP1P09874 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PARP1P09874 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PARP1P09874 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PARP1P09874 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PARP1P09874 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PARP1P09874 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PARP1P09874 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PARP1P09874 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PARP1P09874 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PARP1P09874 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PARP1P09874 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PARP1P09874 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PARP1P09874 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PARP1P09874 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PARP1P09874 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PARP1P09874 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PARP1P09874 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PARP1P09874 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PARP1P09874 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PARP1P09874 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PARP1P09874 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PARP1P09874 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PARP1P09874 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PARP1P09874 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PARP1P09874 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PARP1P09874 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PARP1P09874 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PARP1P09874 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PARP1P09874 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PARP1P09874 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PARP1P09874 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PARP1P09874 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PARP1P09874 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PARP1P09874 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PARP1P09874 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PARP1P09874 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PARP1P09874 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PARP1P09874 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PARP1P09874 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PARP1P09874 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PARP1P09874 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PARP1P09874 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PARP1P09874 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PARP1P09874 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PARP1P09874 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PARP1P09874 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PARP1P09874 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PARP1P09874 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PARP1P09874 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PARP1P09874 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PARP1P09874 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PARP1P09874 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PARP1P09874 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PARP1P09874 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PARP1P09874 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PARP1P09874 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PARP1P09874 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PARP1P09874 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PARP1P09874 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PARP1P09874 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PARP1P09874 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PARP1P09874 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PARP1P09874 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PARP1P09874 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PARP1P09874 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PARP1P09874 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PARP1P09874 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PARP1P09874 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PARP1P09874 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PARP1P09874 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PARP1P09874 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PARP1P09874 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PARP1P09874 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PARP1P09874 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PARP1P09874 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PARP1P09874 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PARP1P09874 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PARP1P09874 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PARP1P09874 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PARP1P09874 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PARP1P09874 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PARP1P09874 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PARP1P09874 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PARP1P09874 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PARP1P09874 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PARP1P09874 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PARP1P09874 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PARP1P09874 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PARP1P09874 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PARP1P09874 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PARP1P09874 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PARP1P09874 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PARP1P09874 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PARP1P09874 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PARP1P09874 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PARP1P09874 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms