Protein–RNA interactions for Protein: P07498

CSN3, Kappa-casein, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSN3P07498 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CSN3P07498 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CSN3P07498 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CSN3P07498 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CSN3P07498 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CSN3P07498 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CSN3P07498 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CSN3P07498 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CSN3P07498 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CSN3P07498 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CSN3P07498 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CSN3P07498 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CSN3P07498 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CSN3P07498 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSN3P07498 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSN3P07498 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSN3P07498 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSN3P07498 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSN3P07498 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSN3P07498 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSN3P07498 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSN3P07498 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSN3P07498 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSN3P07498 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSN3P07498 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSN3P07498 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSN3P07498 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSN3P07498 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSN3P07498 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSN3P07498 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSN3P07498 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSN3P07498 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSN3P07498 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CSN3P07498 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSN3P07498 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSN3P07498 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSN3P07498 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSN3P07498 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSN3P07498 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSN3P07498 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSN3P07498 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSN3P07498 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CSN3P07498 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSN3P07498 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSN3P07498 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSN3P07498 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSN3P07498 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSN3P07498 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSN3P07498 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSN3P07498 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSN3P07498 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSN3P07498 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSN3P07498 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSN3P07498 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSN3P07498 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSN3P07498 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSN3P07498 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSN3P07498 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSN3P07498 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSN3P07498 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSN3P07498 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSN3P07498 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSN3P07498 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSN3P07498 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSN3P07498 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSN3P07498 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSN3P07498 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSN3P07498 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSN3P07498 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSN3P07498 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSN3P07498 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSN3P07498 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSN3P07498 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CSN3P07498 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSN3P07498 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSN3P07498 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSN3P07498 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSN3P07498 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSN3P07498 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSN3P07498 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSN3P07498 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSN3P07498 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSN3P07498 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSN3P07498 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSN3P07498 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSN3P07498 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSN3P07498 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSN3P07498 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSN3P07498 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSN3P07498 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSN3P07498 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSN3P07498 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSN3P07498 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CSN3P07498 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSN3P07498 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSN3P07498 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSN3P07498 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSN3P07498 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSN3P07498 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSN3P07498 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms