Protein–RNA interactions for Protein: P07437

TUBB, Tubulin beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBBP07437 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBBP07437 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBBP07437 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBBP07437 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBBP07437 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBBP07437 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBBP07437 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBBP07437 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBBP07437 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBBP07437 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBBP07437 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBBP07437 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBBP07437 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBBP07437 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBBP07437 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBBP07437 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBBP07437 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBBP07437 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBBP07437 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
TUBBP07437 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBBP07437 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBBP07437 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBBP07437 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBBP07437 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBBP07437 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBBP07437 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBBP07437 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBBP07437 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBBP07437 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBBP07437 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBBP07437 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBBP07437 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TUBBP07437 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TUBBP07437 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TUBBP07437 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TUBBP07437 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TUBBP07437 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TUBBP07437 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TUBBP07437 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TUBBP07437 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TUBBP07437 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TUBBP07437 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBBP07437 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBBP07437 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBBP07437 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBBP07437 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBBP07437 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBBP07437 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBBP07437 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBBP07437 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBBP07437 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBBP07437 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBBP07437 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBBP07437 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBBP07437 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBBP07437 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBBP07437 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBBP07437 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBBP07437 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBBP07437 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBBP07437 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBBP07437 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBBP07437 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBBP07437 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBBP07437 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBBP07437 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBBP07437 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBBP07437 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBBP07437 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBBP07437 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBBP07437 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBBP07437 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBBP07437 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBBP07437 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBBP07437 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBBP07437 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBBP07437 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBBP07437 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBBP07437 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBBP07437 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBBP07437 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBBP07437 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBBP07437 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBBP07437 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBBP07437 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBBP07437 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBBP07437 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBBP07437 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBBP07437 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBBP07437 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBBP07437 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
TUBBP07437 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TUBBP07437 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TUBBP07437 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TUBBP07437 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBBP07437 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBBP07437 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBBP07437 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBBP07437 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBBP07437 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms