Protein–RNA interactions for Protein: P02656

APOC3, Apolipoprotein C-III, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC3P02656 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOC3P02656 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOC3P02656 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOC3P02656 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOC3P02656 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOC3P02656 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOC3P02656 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOC3P02656 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOC3P02656 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOC3P02656 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOC3P02656 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOC3P02656 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOC3P02656 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOC3P02656 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOC3P02656 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOC3P02656 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOC3P02656 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOC3P02656 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOC3P02656 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOC3P02656 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOC3P02656 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOC3P02656 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOC3P02656 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOC3P02656 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOC3P02656 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOC3P02656 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOC3P02656 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOC3P02656 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOC3P02656 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOC3P02656 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOC3P02656 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOC3P02656 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOC3P02656 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOC3P02656 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOC3P02656 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOC3P02656 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOC3P02656 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOC3P02656 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOC3P02656 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOC3P02656 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
APOC3P02656 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOC3P02656 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOC3P02656 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOC3P02656 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOC3P02656 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOC3P02656 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOC3P02656 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOC3P02656 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOC3P02656 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOC3P02656 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOC3P02656 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOC3P02656 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOC3P02656 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOC3P02656 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOC3P02656 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOC3P02656 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOC3P02656 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOC3P02656 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOC3P02656 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOC3P02656 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOC3P02656 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOC3P02656 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOC3P02656 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOC3P02656 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOC3P02656 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOC3P02656 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOC3P02656 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOC3P02656 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOC3P02656 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOC3P02656 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOC3P02656 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOC3P02656 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOC3P02656 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOC3P02656 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOC3P02656 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOC3P02656 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOC3P02656 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOC3P02656 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOC3P02656 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOC3P02656 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOC3P02656 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOC3P02656 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOC3P02656 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOC3P02656 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOC3P02656 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOC3P02656 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOC3P02656 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOC3P02656 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOC3P02656 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOC3P02656 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOC3P02656 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOC3P02656 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOC3P02656 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOC3P02656 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
APOC3P02656 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
APOC3P02656 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
APOC3P02656 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
APOC3P02656 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
APOC3P02656 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
APOC3P02656 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms