Protein–RNA interactions for Protein: O95983

MBD3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3O95983 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
MBD3O95983 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MBD3O95983 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MBD3O95983 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MBD3O95983 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MBD3O95983 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MBD3O95983 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MBD3O95983 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MBD3O95983 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MBD3O95983 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MBD3O95983 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MBD3O95983 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MBD3O95983 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MBD3O95983 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MBD3O95983 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MBD3O95983 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MBD3O95983 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MBD3O95983 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MBD3O95983 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MBD3O95983 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MBD3O95983 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MBD3O95983 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MBD3O95983 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MBD3O95983 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MBD3O95983 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MBD3O95983 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
MBD3O95983 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MBD3O95983 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MBD3O95983 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MBD3O95983 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MBD3O95983 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MBD3O95983 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MBD3O95983 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MBD3O95983 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MBD3O95983 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MBD3O95983 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MBD3O95983 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MBD3O95983 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MBD3O95983 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MBD3O95983 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MBD3O95983 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MBD3O95983 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MBD3O95983 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MBD3O95983 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MBD3O95983 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MBD3O95983 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MBD3O95983 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
MBD3O95983 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MBD3O95983 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MBD3O95983 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MBD3O95983 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MBD3O95983 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MBD3O95983 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MBD3O95983 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MBD3O95983 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MBD3O95983 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MBD3O95983 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MBD3O95983 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MBD3O95983 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
MBD3O95983 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MBD3O95983 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MBD3O95983 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MBD3O95983 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MBD3O95983 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MBD3O95983 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MBD3O95983 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MBD3O95983 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MBD3O95983 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MBD3O95983 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MBD3O95983 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MBD3O95983 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MBD3O95983 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MBD3O95983 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MBD3O95983 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MBD3O95983 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MBD3O95983 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MBD3O95983 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MBD3O95983 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MBD3O95983 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MBD3O95983 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MBD3O95983 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
MBD3O95983 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MBD3O95983 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MBD3O95983 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
MBD3O95983 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
MBD3O95983 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MBD3O95983 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MBD3O95983 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MBD3O95983 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MBD3O95983 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MBD3O95983 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MBD3O95983 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MBD3O95983 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MBD3O95983 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MBD3O95983 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
MBD3O95983 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MBD3O95983 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MBD3O95983 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MBD3O95983 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
MBD3O95983 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms