Protein–RNA interactions for Protein: O95473

SYNGR4, Synaptogyrin-4, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR4O95473 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
SYNGR4O95473 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
SYNGR4O95473 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
SYNGR4O95473 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SYNGR4O95473 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SYNGR4O95473 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SYNGR4O95473 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SYNGR4O95473 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SYNGR4O95473 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SYNGR4O95473 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SYNGR4O95473 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SYNGR4O95473 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SYNGR4O95473 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SYNGR4O95473 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SYNGR4O95473 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SYNGR4O95473 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SYNGR4O95473 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SYNGR4O95473 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SYNGR4O95473 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYNGR4O95473 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYNGR4O95473 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYNGR4O95473 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYNGR4O95473 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYNGR4O95473 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYNGR4O95473 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYNGR4O95473 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYNGR4O95473 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYNGR4O95473 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYNGR4O95473 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SYNGR4O95473 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SYNGR4O95473 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SYNGR4O95473 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SYNGR4O95473 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SYNGR4O95473 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SYNGR4O95473 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SYNGR4O95473 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SYNGR4O95473 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SYNGR4O95473 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SYNGR4O95473 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SYNGR4O95473 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SYNGR4O95473 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SYNGR4O95473 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SYNGR4O95473 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SYNGR4O95473 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SYNGR4O95473 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SYNGR4O95473 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SYNGR4O95473 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SYNGR4O95473 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SYNGR4O95473 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
SYNGR4O95473 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SYNGR4O95473 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SYNGR4O95473 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SYNGR4O95473 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SYNGR4O95473 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SYNGR4O95473 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SYNGR4O95473 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SYNGR4O95473 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SYNGR4O95473 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SYNGR4O95473 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SYNGR4O95473 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SYNGR4O95473 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SYNGR4O95473 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SYNGR4O95473 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SYNGR4O95473 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SYNGR4O95473 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SYNGR4O95473 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SYNGR4O95473 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
SYNGR4O95473 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SYNGR4O95473 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SYNGR4O95473 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SYNGR4O95473 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SYNGR4O95473 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SYNGR4O95473 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SYNGR4O95473 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SYNGR4O95473 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SYNGR4O95473 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SYNGR4O95473 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SYNGR4O95473 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SYNGR4O95473 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SYNGR4O95473 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SYNGR4O95473 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SYNGR4O95473 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SYNGR4O95473 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SYNGR4O95473 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SYNGR4O95473 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SYNGR4O95473 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SYNGR4O95473 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SYNGR4O95473 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SYNGR4O95473 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SYNGR4O95473 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SYNGR4O95473 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SYNGR4O95473 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SYNGR4O95473 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SYNGR4O95473 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SYNGR4O95473 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SYNGR4O95473 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SYNGR4O95473 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SYNGR4O95473 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SYNGR4O95473 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SYNGR4O95473 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 309.2 ms