Protein–RNA interactions for Protein: O95342

ABCB11, Bile salt export pump, humanhuman

Predictions only

Length 1,321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB11O95342 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCB11O95342 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCB11O95342 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCB11O95342 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCB11O95342 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCB11O95342 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCB11O95342 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCB11O95342 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCB11O95342 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCB11O95342 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ABCB11O95342 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ABCB11O95342 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ABCB11O95342 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ABCB11O95342 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ABCB11O95342 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ABCB11O95342 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ABCB11O95342 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ABCB11O95342 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ABCB11O95342 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ABCB11O95342 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ABCB11O95342 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ABCB11O95342 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ABCB11O95342 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ABCB11O95342 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ABCB11O95342 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ABCB11O95342 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ABCB11O95342 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ABCB11O95342 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ABCB11O95342 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ABCB11O95342 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ABCB11O95342 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ABCB11O95342 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ABCB11O95342 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ABCB11O95342 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ABCB11O95342 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ABCB11O95342 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ABCB11O95342 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ABCB11O95342 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ABCB11O95342 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ABCB11O95342 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ABCB11O95342 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ABCB11O95342 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ABCB11O95342 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ABCB11O95342 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ABCB11O95342 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ABCB11O95342 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ABCB11O95342 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ABCB11O95342 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ABCB11O95342 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ABCB11O95342 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ABCB11O95342 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ABCB11O95342 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ABCB11O95342 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ABCB11O95342 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ABCB11O95342 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ABCB11O95342 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ABCB11O95342 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
ABCB11O95342 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ABCB11O95342 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
ABCB11O95342 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ABCB11O95342 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ABCB11O95342 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ABCB11O95342 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ABCB11O95342 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ABCB11O95342 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ABCB11O95342 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ABCB11O95342 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCB11O95342 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCB11O95342 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCB11O95342 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCB11O95342 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCB11O95342 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCB11O95342 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCB11O95342 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCB11O95342 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCB11O95342 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ABCB11O95342 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ABCB11O95342 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ABCB11O95342 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ABCB11O95342 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ABCB11O95342 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ABCB11O95342 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ABCB11O95342 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ABCB11O95342 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ABCB11O95342 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ABCB11O95342 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ABCB11O95342 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ABCB11O95342 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ABCB11O95342 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ABCB11O95342 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ABCB11O95342 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCB11O95342 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCB11O95342 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCB11O95342 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCB11O95342 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCB11O95342 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCB11O95342 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCB11O95342 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCB11O95342 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCB11O95342 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms