Protein–RNA interactions for Protein: O95273

CCNDBP1, Cyclin-D1-binding protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1O95273 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCNDBP1O95273 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCNDBP1O95273 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCNDBP1O95273 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCNDBP1O95273 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCNDBP1O95273 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCNDBP1O95273 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCNDBP1O95273 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCNDBP1O95273 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCNDBP1O95273 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCNDBP1O95273 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCNDBP1O95273 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCNDBP1O95273 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCNDBP1O95273 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCNDBP1O95273 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCNDBP1O95273 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCNDBP1O95273 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCNDBP1O95273 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CCNDBP1O95273 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCNDBP1O95273 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCNDBP1O95273 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCNDBP1O95273 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CCNDBP1O95273 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CCNDBP1O95273 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCNDBP1O95273 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCNDBP1O95273 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCNDBP1O95273 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCNDBP1O95273 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
CCNDBP1O95273 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCNDBP1O95273 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCNDBP1O95273 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCNDBP1O95273 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCNDBP1O95273 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCNDBP1O95273 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCNDBP1O95273 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCNDBP1O95273 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCNDBP1O95273 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCNDBP1O95273 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCNDBP1O95273 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCNDBP1O95273 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCNDBP1O95273 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCNDBP1O95273 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCNDBP1O95273 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCNDBP1O95273 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCNDBP1O95273 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCNDBP1O95273 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCNDBP1O95273 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCNDBP1O95273 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCNDBP1O95273 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCNDBP1O95273 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCNDBP1O95273 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCNDBP1O95273 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCNDBP1O95273 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCNDBP1O95273 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCNDBP1O95273 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCNDBP1O95273 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCNDBP1O95273 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCNDBP1O95273 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCNDBP1O95273 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCNDBP1O95273 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCNDBP1O95273 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCNDBP1O95273 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCNDBP1O95273 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCNDBP1O95273 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCNDBP1O95273 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCNDBP1O95273 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCNDBP1O95273 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCNDBP1O95273 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CCNDBP1O95273 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCNDBP1O95273 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCNDBP1O95273 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCNDBP1O95273 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCNDBP1O95273 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCNDBP1O95273 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCNDBP1O95273 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCNDBP1O95273 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCNDBP1O95273 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCNDBP1O95273 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCNDBP1O95273 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCNDBP1O95273 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCNDBP1O95273 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCNDBP1O95273 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCNDBP1O95273 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCNDBP1O95273 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CCNDBP1O95273 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCNDBP1O95273 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCNDBP1O95273 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCNDBP1O95273 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCNDBP1O95273 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCNDBP1O95273 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCNDBP1O95273 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCNDBP1O95273 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCNDBP1O95273 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCNDBP1O95273 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCNDBP1O95273 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCNDBP1O95273 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCNDBP1O95273 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCNDBP1O95273 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCNDBP1O95273 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCNDBP1O95273 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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