Protein–RNA interactions for Protein: O94898

LRIG2, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,065 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG2O94898 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRIG2O94898 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRIG2O94898 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRIG2O94898 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRIG2O94898 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRIG2O94898 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRIG2O94898 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRIG2O94898 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRIG2O94898 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRIG2O94898 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRIG2O94898 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRIG2O94898 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LRIG2O94898 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRIG2O94898 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRIG2O94898 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRIG2O94898 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRIG2O94898 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LRIG2O94898 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRIG2O94898 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRIG2O94898 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LRIG2O94898 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRIG2O94898 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRIG2O94898 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRIG2O94898 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRIG2O94898 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRIG2O94898 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRIG2O94898 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRIG2O94898 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
LRIG2O94898 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRIG2O94898 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRIG2O94898 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRIG2O94898 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRIG2O94898 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRIG2O94898 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRIG2O94898 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRIG2O94898 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LRIG2O94898 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LRIG2O94898 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRIG2O94898 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRIG2O94898 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRIG2O94898 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRIG2O94898 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRIG2O94898 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRIG2O94898 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRIG2O94898 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRIG2O94898 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRIG2O94898 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRIG2O94898 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRIG2O94898 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRIG2O94898 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRIG2O94898 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRIG2O94898 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRIG2O94898 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRIG2O94898 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRIG2O94898 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRIG2O94898 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRIG2O94898 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LRIG2O94898 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRIG2O94898 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRIG2O94898 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRIG2O94898 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRIG2O94898 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRIG2O94898 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRIG2O94898 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRIG2O94898 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRIG2O94898 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRIG2O94898 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRIG2O94898 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRIG2O94898 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRIG2O94898 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRIG2O94898 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRIG2O94898 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRIG2O94898 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRIG2O94898 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRIG2O94898 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRIG2O94898 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRIG2O94898 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRIG2O94898 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRIG2O94898 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRIG2O94898 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRIG2O94898 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRIG2O94898 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LRIG2O94898 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRIG2O94898 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRIG2O94898 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRIG2O94898 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRIG2O94898 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LRIG2O94898 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRIG2O94898 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRIG2O94898 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRIG2O94898 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRIG2O94898 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRIG2O94898 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRIG2O94898 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRIG2O94898 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRIG2O94898 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
LRIG2O94898 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRIG2O94898 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRIG2O94898 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRIG2O94898 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms