Protein–RNA interactions for Protein: O94788

ALDH1A2, Retinal dehydrogenase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH1A2O94788 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ALDH1A2O94788 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ALDH1A2O94788 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ALDH1A2O94788 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ALDH1A2O94788 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ALDH1A2O94788 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ALDH1A2O94788 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ALDH1A2O94788 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ALDH1A2O94788 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ALDH1A2O94788 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ALDH1A2O94788 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ALDH1A2O94788 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ALDH1A2O94788 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ALDH1A2O94788 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ALDH1A2O94788 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ALDH1A2O94788 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ALDH1A2O94788 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ALDH1A2O94788 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ALDH1A2O94788 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ALDH1A2O94788 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ALDH1A2O94788 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ALDH1A2O94788 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ALDH1A2O94788 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ALDH1A2O94788 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ALDH1A2O94788 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ALDH1A2O94788 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ALDH1A2O94788 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ALDH1A2O94788 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ALDH1A2O94788 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ALDH1A2O94788 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ALDH1A2O94788 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ALDH1A2O94788 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ALDH1A2O94788 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ALDH1A2O94788 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ALDH1A2O94788 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ALDH1A2O94788 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ALDH1A2O94788 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ALDH1A2O94788 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ALDH1A2O94788 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ALDH1A2O94788 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ALDH1A2O94788 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ALDH1A2O94788 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ALDH1A2O94788 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ALDH1A2O94788 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ALDH1A2O94788 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ALDH1A2O94788 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ALDH1A2O94788 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ALDH1A2O94788 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ALDH1A2O94788 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ALDH1A2O94788 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ALDH1A2O94788 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ALDH1A2O94788 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ALDH1A2O94788 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ALDH1A2O94788 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ALDH1A2O94788 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ALDH1A2O94788 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ALDH1A2O94788 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ALDH1A2O94788 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ALDH1A2O94788 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ALDH1A2O94788 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ALDH1A2O94788 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ALDH1A2O94788 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ALDH1A2O94788 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ALDH1A2O94788 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ALDH1A2O94788 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ALDH1A2O94788 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ALDH1A2O94788 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ALDH1A2O94788 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ALDH1A2O94788 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ALDH1A2O94788 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ALDH1A2O94788 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ALDH1A2O94788 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ALDH1A2O94788 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ALDH1A2O94788 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ALDH1A2O94788 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ALDH1A2O94788 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ALDH1A2O94788 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ALDH1A2O94788 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ALDH1A2O94788 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ALDH1A2O94788 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ALDH1A2O94788 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ALDH1A2O94788 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ALDH1A2O94788 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ALDH1A2O94788 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ALDH1A2O94788 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ALDH1A2O94788 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ALDH1A2O94788 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ALDH1A2O94788 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ALDH1A2O94788 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ALDH1A2O94788 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ALDH1A2O94788 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ALDH1A2O94788 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ALDH1A2O94788 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ALDH1A2O94788 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ALDH1A2O94788 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ALDH1A2O94788 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ALDH1A2O94788 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ALDH1A2O94788 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ALDH1A2O94788 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ALDH1A2O94788 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms