Protein–RNA interactions for Protein: O75935

DCTN3, Dynactin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN3O75935 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DCTN3O75935 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DCTN3O75935 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DCTN3O75935 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DCTN3O75935 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DCTN3O75935 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DCTN3O75935 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DCTN3O75935 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DCTN3O75935 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DCTN3O75935 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
DCTN3O75935 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
DCTN3O75935 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
DCTN3O75935 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
DCTN3O75935 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
DCTN3O75935 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
DCTN3O75935 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DCTN3O75935 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DCTN3O75935 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DCTN3O75935 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DCTN3O75935 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DCTN3O75935 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DCTN3O75935 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DCTN3O75935 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DCTN3O75935 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DCTN3O75935 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DCTN3O75935 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DCTN3O75935 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DCTN3O75935 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DCTN3O75935 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DCTN3O75935 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
DCTN3O75935 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DCTN3O75935 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DCTN3O75935 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DCTN3O75935 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DCTN3O75935 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DCTN3O75935 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DCTN3O75935 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DCTN3O75935 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DCTN3O75935 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DCTN3O75935 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DCTN3O75935 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DCTN3O75935 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DCTN3O75935 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DCTN3O75935 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DCTN3O75935 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DCTN3O75935 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DCTN3O75935 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DCTN3O75935 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DCTN3O75935 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DCTN3O75935 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DCTN3O75935 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DCTN3O75935 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DCTN3O75935 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DCTN3O75935 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DCTN3O75935 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DCTN3O75935 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DCTN3O75935 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DCTN3O75935 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DCTN3O75935 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
DCTN3O75935 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DCTN3O75935 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DCTN3O75935 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DCTN3O75935 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DCTN3O75935 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
DCTN3O75935 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DCTN3O75935 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DCTN3O75935 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DCTN3O75935 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DCTN3O75935 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DCTN3O75935 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DCTN3O75935 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DCTN3O75935 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DCTN3O75935 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DCTN3O75935 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DCTN3O75935 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DCTN3O75935 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DCTN3O75935 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DCTN3O75935 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DCTN3O75935 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DCTN3O75935 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DCTN3O75935 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DCTN3O75935 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DCTN3O75935 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DCTN3O75935 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DCTN3O75935 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DCTN3O75935 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DCTN3O75935 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DCTN3O75935 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DCTN3O75935 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DCTN3O75935 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DCTN3O75935 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DCTN3O75935 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DCTN3O75935 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
DCTN3O75935 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DCTN3O75935 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DCTN3O75935 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DCTN3O75935 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DCTN3O75935 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DCTN3O75935 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DCTN3O75935 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms